Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMB8

Cyfip1, Cytoplasmic FMR1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyfip1Q7TMB8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cyfip1Q7TMB8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cyfip1Q7TMB8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cyfip1Q7TMB8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cyfip1Q7TMB8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cyfip1Q7TMB8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cyfip1Q7TMB8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cyfip1Q7TMB8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cyfip1Q7TMB8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cyfip1Q7TMB8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cyfip1Q7TMB8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cyfip1Q7TMB8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cyfip1Q7TMB8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Cyfip1Q7TMB8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cyfip1Q7TMB8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cyfip1Q7TMB8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cyfip1Q7TMB8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Cyfip1Q7TMB8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cyfip1Q7TMB8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cyfip1Q7TMB8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cyfip1Q7TMB8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cyfip1Q7TMB8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cyfip1Q7TMB8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Cyfip1Q7TMB8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cyfip1Q7TMB8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cyfip1Q7TMB8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cyfip1Q7TMB8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cyfip1Q7TMB8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Cyfip1Q7TMB8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cyfip1Q7TMB8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cyfip1Q7TMB8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cyfip1Q7TMB8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cyfip1Q7TMB8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cyfip1Q7TMB8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cyfip1Q7TMB8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cyfip1Q7TMB8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cyfip1Q7TMB8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cyfip1Q7TMB8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cyfip1Q7TMB8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cyfip1Q7TMB8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cyfip1Q7TMB8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cyfip1Q7TMB8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cyfip1Q7TMB8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cyfip1Q7TMB8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cyfip1Q7TMB8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cyfip1Q7TMB8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cyfip1Q7TMB8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cyfip1Q7TMB8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cyfip1Q7TMB8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cyfip1Q7TMB8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cyfip1Q7TMB8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cyfip1Q7TMB8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cyfip1Q7TMB8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cyfip1Q7TMB8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cyfip1Q7TMB8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cyfip1Q7TMB8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cyfip1Q7TMB8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cyfip1Q7TMB8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cyfip1Q7TMB8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cyfip1Q7TMB8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cyfip1Q7TMB8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cyfip1Q7TMB8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cyfip1Q7TMB8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Cyfip1Q7TMB8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cyfip1Q7TMB8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cyfip1Q7TMB8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cyfip1Q7TMB8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cyfip1Q7TMB8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cyfip1Q7TMB8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cyfip1Q7TMB8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cyfip1Q7TMB8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cyfip1Q7TMB8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cyfip1Q7TMB8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cyfip1Q7TMB8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cyfip1Q7TMB8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cyfip1Q7TMB8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cyfip1Q7TMB8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cyfip1Q7TMB8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cyfip1Q7TMB8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cyfip1Q7TMB8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cyfip1Q7TMB8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cyfip1Q7TMB8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cyfip1Q7TMB8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cyfip1Q7TMB8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cyfip1Q7TMB8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cyfip1Q7TMB8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cyfip1Q7TMB8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Cyfip1Q7TMB8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cyfip1Q7TMB8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cyfip1Q7TMB8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cyfip1Q7TMB8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cyfip1Q7TMB8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cyfip1Q7TMB8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cyfip1Q7TMB8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cyfip1Q7TMB8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cyfip1Q7TMB8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cyfip1Q7TMB8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cyfip1Q7TMB8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Cyfip1Q7TMB8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cyfip1Q7TMB8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms