Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ScocQ78YZ6 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ScocQ78YZ6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ScocQ78YZ6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ScocQ78YZ6 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ScocQ78YZ6 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ScocQ78YZ6 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ScocQ78YZ6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ScocQ78YZ6 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ScocQ78YZ6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ScocQ78YZ6 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ScocQ78YZ6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ScocQ78YZ6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ScocQ78YZ6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ScocQ78YZ6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ScocQ78YZ6 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ScocQ78YZ6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ScocQ78YZ6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ScocQ78YZ6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ScocQ78YZ6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ScocQ78YZ6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ScocQ78YZ6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ScocQ78YZ6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ScocQ78YZ6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ScocQ78YZ6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ScocQ78YZ6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ScocQ78YZ6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ScocQ78YZ6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ScocQ78YZ6 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ScocQ78YZ6 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ScocQ78YZ6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ScocQ78YZ6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ScocQ78YZ6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ScocQ78YZ6 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ScocQ78YZ6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ScocQ78YZ6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ScocQ78YZ6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ScocQ78YZ6 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ScocQ78YZ6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ScocQ78YZ6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ScocQ78YZ6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ScocQ78YZ6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ScocQ78YZ6 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ScocQ78YZ6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ScocQ78YZ6 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ScocQ78YZ6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ScocQ78YZ6 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ScocQ78YZ6 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ScocQ78YZ6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ScocQ78YZ6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ScocQ78YZ6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ScocQ78YZ6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ScocQ78YZ6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ScocQ78YZ6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ScocQ78YZ6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ScocQ78YZ6 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ScocQ78YZ6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ScocQ78YZ6 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ScocQ78YZ6 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ScocQ78YZ6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ScocQ78YZ6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ScocQ78YZ6 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ScocQ78YZ6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ScocQ78YZ6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ScocQ78YZ6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ScocQ78YZ6 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ScocQ78YZ6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ScocQ78YZ6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ScocQ78YZ6 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ScocQ78YZ6 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ScocQ78YZ6 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ScocQ78YZ6 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ScocQ78YZ6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ScocQ78YZ6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ScocQ78YZ6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ScocQ78YZ6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ScocQ78YZ6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ScocQ78YZ6 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ScocQ78YZ6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ScocQ78YZ6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ScocQ78YZ6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ScocQ78YZ6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ScocQ78YZ6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ScocQ78YZ6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ScocQ78YZ6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ScocQ78YZ6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ScocQ78YZ6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ScocQ78YZ6 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.62
ScocQ78YZ6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ScocQ78YZ6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ScocQ78YZ6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ScocQ78YZ6 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ScocQ78YZ6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ScocQ78YZ6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ScocQ78YZ6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ScocQ78YZ6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ScocQ78YZ6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ScocQ78YZ6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ScocQ78YZ6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ScocQ78YZ6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms