Protein–RNA interactions for Protein: Q78Y63

Pdcl2, Phosducin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl2Q78Y63 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pdcl2Q78Y63 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pdcl2Q78Y63 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pdcl2Q78Y63 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pdcl2Q78Y63 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pdcl2Q78Y63 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pdcl2Q78Y63 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pdcl2Q78Y63 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pdcl2Q78Y63 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pdcl2Q78Y63 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pdcl2Q78Y63 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Pdcl2Q78Y63 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pdcl2Q78Y63 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pdcl2Q78Y63 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pdcl2Q78Y63 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pdcl2Q78Y63 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pdcl2Q78Y63 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pdcl2Q78Y63 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pdcl2Q78Y63 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pdcl2Q78Y63 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pdcl2Q78Y63 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pdcl2Q78Y63 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pdcl2Q78Y63 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pdcl2Q78Y63 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pdcl2Q78Y63 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pdcl2Q78Y63 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pdcl2Q78Y63 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pdcl2Q78Y63 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pdcl2Q78Y63 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Pdcl2Q78Y63 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pdcl2Q78Y63 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pdcl2Q78Y63 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pdcl2Q78Y63 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pdcl2Q78Y63 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pdcl2Q78Y63 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pdcl2Q78Y63 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pdcl2Q78Y63 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pdcl2Q78Y63 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pdcl2Q78Y63 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pdcl2Q78Y63 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pdcl2Q78Y63 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pdcl2Q78Y63 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pdcl2Q78Y63 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pdcl2Q78Y63 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Pdcl2Q78Y63 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pdcl2Q78Y63 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pdcl2Q78Y63 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pdcl2Q78Y63 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pdcl2Q78Y63 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pdcl2Q78Y63 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pdcl2Q78Y63 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pdcl2Q78Y63 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pdcl2Q78Y63 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pdcl2Q78Y63 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pdcl2Q78Y63 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pdcl2Q78Y63 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pdcl2Q78Y63 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pdcl2Q78Y63 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pdcl2Q78Y63 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pdcl2Q78Y63 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pdcl2Q78Y63 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pdcl2Q78Y63 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pdcl2Q78Y63 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pdcl2Q78Y63 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pdcl2Q78Y63 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pdcl2Q78Y63 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pdcl2Q78Y63 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pdcl2Q78Y63 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pdcl2Q78Y63 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pdcl2Q78Y63 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pdcl2Q78Y63 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pdcl2Q78Y63 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pdcl2Q78Y63 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pdcl2Q78Y63 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pdcl2Q78Y63 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Pdcl2Q78Y63 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pdcl2Q78Y63 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pdcl2Q78Y63 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pdcl2Q78Y63 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pdcl2Q78Y63 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pdcl2Q78Y63 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pdcl2Q78Y63 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pdcl2Q78Y63 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pdcl2Q78Y63 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pdcl2Q78Y63 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pdcl2Q78Y63 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pdcl2Q78Y63 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pdcl2Q78Y63 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pdcl2Q78Y63 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pdcl2Q78Y63 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pdcl2Q78Y63 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pdcl2Q78Y63 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pdcl2Q78Y63 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pdcl2Q78Y63 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pdcl2Q78Y63 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pdcl2Q78Y63 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdcl2Q78Y63 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdcl2Q78Y63 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdcl2Q78Y63 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdcl2Q78Y63 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms