Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smim12Q78RX3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smim12Q78RX3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smim12Q78RX3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Smim12Q78RX3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smim12Q78RX3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smim12Q78RX3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smim12Q78RX3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smim12Q78RX3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smim12Q78RX3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smim12Q78RX3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smim12Q78RX3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smim12Q78RX3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smim12Q78RX3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smim12Q78RX3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smim12Q78RX3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smim12Q78RX3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smim12Q78RX3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smim12Q78RX3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smim12Q78RX3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smim12Q78RX3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smim12Q78RX3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smim12Q78RX3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smim12Q78RX3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smim12Q78RX3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smim12Q78RX3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smim12Q78RX3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Smim12Q78RX3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smim12Q78RX3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smim12Q78RX3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smim12Q78RX3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smim12Q78RX3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smim12Q78RX3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Smim12Q78RX3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smim12Q78RX3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Smim12Q78RX3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smim12Q78RX3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smim12Q78RX3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smim12Q78RX3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smim12Q78RX3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smim12Q78RX3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smim12Q78RX3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smim12Q78RX3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smim12Q78RX3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smim12Q78RX3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smim12Q78RX3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smim12Q78RX3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smim12Q78RX3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smim12Q78RX3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smim12Q78RX3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smim12Q78RX3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smim12Q78RX3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smim12Q78RX3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Smim12Q78RX3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smim12Q78RX3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smim12Q78RX3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smim12Q78RX3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smim12Q78RX3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smim12Q78RX3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smim12Q78RX3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smim12Q78RX3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Smim12Q78RX3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smim12Q78RX3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smim12Q78RX3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smim12Q78RX3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smim12Q78RX3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smim12Q78RX3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smim12Q78RX3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smim12Q78RX3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smim12Q78RX3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smim12Q78RX3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smim12Q78RX3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smim12Q78RX3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smim12Q78RX3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smim12Q78RX3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smim12Q78RX3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smim12Q78RX3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smim12Q78RX3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smim12Q78RX3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smim12Q78RX3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smim12Q78RX3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smim12Q78RX3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smim12Q78RX3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smim12Q78RX3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smim12Q78RX3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Smim12Q78RX3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smim12Q78RX3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smim12Q78RX3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smim12Q78RX3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smim12Q78RX3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smim12Q78RX3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smim12Q78RX3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smim12Q78RX3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smim12Q78RX3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smim12Q78RX3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smim12Q78RX3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smim12Q78RX3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Smim12Q78RX3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smim12Q78RX3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smim12Q78RX3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms