Protein–RNA interactions for Protein: Q78HU3

Mvb12a, Multivesicular body subunit 12A, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mvb12aQ78HU3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mvb12aQ78HU3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mvb12aQ78HU3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mvb12aQ78HU3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mvb12aQ78HU3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mvb12aQ78HU3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mvb12aQ78HU3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Mvb12aQ78HU3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mvb12aQ78HU3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mvb12aQ78HU3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Mvb12aQ78HU3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mvb12aQ78HU3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mvb12aQ78HU3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mvb12aQ78HU3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mvb12aQ78HU3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mvb12aQ78HU3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mvb12aQ78HU3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mvb12aQ78HU3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mvb12aQ78HU3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mvb12aQ78HU3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mvb12aQ78HU3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Mvb12aQ78HU3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mvb12aQ78HU3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mvb12aQ78HU3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mvb12aQ78HU3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mvb12aQ78HU3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mvb12aQ78HU3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mvb12aQ78HU3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mvb12aQ78HU3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mvb12aQ78HU3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mvb12aQ78HU3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mvb12aQ78HU3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mvb12aQ78HU3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mvb12aQ78HU3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Mvb12aQ78HU3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mvb12aQ78HU3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mvb12aQ78HU3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mvb12aQ78HU3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mvb12aQ78HU3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mvb12aQ78HU3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Mvb12aQ78HU3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mvb12aQ78HU3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mvb12aQ78HU3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mvb12aQ78HU3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mvb12aQ78HU3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mvb12aQ78HU3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mvb12aQ78HU3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mvb12aQ78HU3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mvb12aQ78HU3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mvb12aQ78HU3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mvb12aQ78HU3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mvb12aQ78HU3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mvb12aQ78HU3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mvb12aQ78HU3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mvb12aQ78HU3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mvb12aQ78HU3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mvb12aQ78HU3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mvb12aQ78HU3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mvb12aQ78HU3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mvb12aQ78HU3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mvb12aQ78HU3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mvb12aQ78HU3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mvb12aQ78HU3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mvb12aQ78HU3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mvb12aQ78HU3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mvb12aQ78HU3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mvb12aQ78HU3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mvb12aQ78HU3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mvb12aQ78HU3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mvb12aQ78HU3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mvb12aQ78HU3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mvb12aQ78HU3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mvb12aQ78HU3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mvb12aQ78HU3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mvb12aQ78HU3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mvb12aQ78HU3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mvb12aQ78HU3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mvb12aQ78HU3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mvb12aQ78HU3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mvb12aQ78HU3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mvb12aQ78HU3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mvb12aQ78HU3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mvb12aQ78HU3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mvb12aQ78HU3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mvb12aQ78HU3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mvb12aQ78HU3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mvb12aQ78HU3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Mvb12aQ78HU3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mvb12aQ78HU3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Mvb12aQ78HU3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mvb12aQ78HU3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mvb12aQ78HU3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mvb12aQ78HU3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mvb12aQ78HU3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mvb12aQ78HU3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mvb12aQ78HU3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mvb12aQ78HU3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mvb12aQ78HU3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mvb12aQ78HU3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mvb12aQ78HU3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms