Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR4

Kcnt1, Potassium channel subfamily T member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnt1Q6ZPR4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kcnt1Q6ZPR4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kcnt1Q6ZPR4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kcnt1Q6ZPR4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kcnt1Q6ZPR4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kcnt1Q6ZPR4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kcnt1Q6ZPR4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kcnt1Q6ZPR4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kcnt1Q6ZPR4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kcnt1Q6ZPR4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kcnt1Q6ZPR4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Kcnt1Q6ZPR4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kcnt1Q6ZPR4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kcnt1Q6ZPR4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kcnt1Q6ZPR4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Kcnt1Q6ZPR4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kcnt1Q6ZPR4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kcnt1Q6ZPR4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kcnt1Q6ZPR4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kcnt1Q6ZPR4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kcnt1Q6ZPR4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kcnt1Q6ZPR4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kcnt1Q6ZPR4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kcnt1Q6ZPR4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kcnt1Q6ZPR4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kcnt1Q6ZPR4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kcnt1Q6ZPR4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kcnt1Q6ZPR4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kcnt1Q6ZPR4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Kcnt1Q6ZPR4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kcnt1Q6ZPR4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kcnt1Q6ZPR4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kcnt1Q6ZPR4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kcnt1Q6ZPR4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kcnt1Q6ZPR4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kcnt1Q6ZPR4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kcnt1Q6ZPR4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kcnt1Q6ZPR4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kcnt1Q6ZPR4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kcnt1Q6ZPR4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kcnt1Q6ZPR4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kcnt1Q6ZPR4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Kcnt1Q6ZPR4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kcnt1Q6ZPR4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kcnt1Q6ZPR4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kcnt1Q6ZPR4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kcnt1Q6ZPR4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kcnt1Q6ZPR4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kcnt1Q6ZPR4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kcnt1Q6ZPR4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kcnt1Q6ZPR4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kcnt1Q6ZPR4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kcnt1Q6ZPR4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kcnt1Q6ZPR4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kcnt1Q6ZPR4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kcnt1Q6ZPR4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kcnt1Q6ZPR4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kcnt1Q6ZPR4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kcnt1Q6ZPR4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kcnt1Q6ZPR4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kcnt1Q6ZPR4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kcnt1Q6ZPR4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kcnt1Q6ZPR4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kcnt1Q6ZPR4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kcnt1Q6ZPR4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kcnt1Q6ZPR4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kcnt1Q6ZPR4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kcnt1Q6ZPR4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kcnt1Q6ZPR4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Kcnt1Q6ZPR4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kcnt1Q6ZPR4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Kcnt1Q6ZPR4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kcnt1Q6ZPR4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kcnt1Q6ZPR4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kcnt1Q6ZPR4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Kcnt1Q6ZPR4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kcnt1Q6ZPR4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kcnt1Q6ZPR4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kcnt1Q6ZPR4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kcnt1Q6ZPR4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kcnt1Q6ZPR4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kcnt1Q6ZPR4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kcnt1Q6ZPR4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kcnt1Q6ZPR4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kcnt1Q6ZPR4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kcnt1Q6ZPR4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kcnt1Q6ZPR4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kcnt1Q6ZPR4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kcnt1Q6ZPR4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kcnt1Q6ZPR4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kcnt1Q6ZPR4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kcnt1Q6ZPR4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kcnt1Q6ZPR4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kcnt1Q6ZPR4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kcnt1Q6ZPR4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kcnt1Q6ZPR4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kcnt1Q6ZPR4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kcnt1Q6ZPR4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Kcnt1Q6ZPR4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kcnt1Q6ZPR4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120 ms