Protein–RNA interactions for Protein: Q6W5C0

Cxcl3, C-X-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl3Q6W5C0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cxcl3Q6W5C0 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cxcl3Q6W5C0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cxcl3Q6W5C0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cxcl3Q6W5C0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cxcl3Q6W5C0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cxcl3Q6W5C0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cxcl3Q6W5C0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cxcl3Q6W5C0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cxcl3Q6W5C0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cxcl3Q6W5C0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cxcl3Q6W5C0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cxcl3Q6W5C0 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cxcl3Q6W5C0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cxcl3Q6W5C0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cxcl3Q6W5C0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cxcl3Q6W5C0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cxcl3Q6W5C0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cxcl3Q6W5C0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cxcl3Q6W5C0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cxcl3Q6W5C0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Cxcl3Q6W5C0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cxcl3Q6W5C0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cxcl3Q6W5C0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cxcl3Q6W5C0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cxcl3Q6W5C0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cxcl3Q6W5C0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cxcl3Q6W5C0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Cxcl3Q6W5C0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cxcl3Q6W5C0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Cxcl3Q6W5C0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Cxcl3Q6W5C0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cxcl3Q6W5C0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cxcl3Q6W5C0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cxcl3Q6W5C0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cxcl3Q6W5C0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cxcl3Q6W5C0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cxcl3Q6W5C0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cxcl3Q6W5C0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cxcl3Q6W5C0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cxcl3Q6W5C0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cxcl3Q6W5C0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cxcl3Q6W5C0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cxcl3Q6W5C0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cxcl3Q6W5C0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cxcl3Q6W5C0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cxcl3Q6W5C0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cxcl3Q6W5C0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cxcl3Q6W5C0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cxcl3Q6W5C0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cxcl3Q6W5C0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cxcl3Q6W5C0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cxcl3Q6W5C0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cxcl3Q6W5C0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cxcl3Q6W5C0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cxcl3Q6W5C0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cxcl3Q6W5C0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cxcl3Q6W5C0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cxcl3Q6W5C0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cxcl3Q6W5C0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cxcl3Q6W5C0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cxcl3Q6W5C0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cxcl3Q6W5C0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cxcl3Q6W5C0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cxcl3Q6W5C0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cxcl3Q6W5C0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cxcl3Q6W5C0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cxcl3Q6W5C0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cxcl3Q6W5C0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cxcl3Q6W5C0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cxcl3Q6W5C0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cxcl3Q6W5C0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cxcl3Q6W5C0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cxcl3Q6W5C0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cxcl3Q6W5C0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cxcl3Q6W5C0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cxcl3Q6W5C0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cxcl3Q6W5C0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cxcl3Q6W5C0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cxcl3Q6W5C0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Cxcl3Q6W5C0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Cxcl3Q6W5C0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cxcl3Q6W5C0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cxcl3Q6W5C0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cxcl3Q6W5C0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cxcl3Q6W5C0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cxcl3Q6W5C0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cxcl3Q6W5C0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cxcl3Q6W5C0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cxcl3Q6W5C0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Cxcl3Q6W5C0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cxcl3Q6W5C0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cxcl3Q6W5C0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cxcl3Q6W5C0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cxcl3Q6W5C0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cxcl3Q6W5C0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cxcl3Q6W5C0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cxcl3Q6W5C0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cxcl3Q6W5C0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cxcl3Q6W5C0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms