Protein–RNA interactions for Protein: Q6UGQ3

Scgb2b2, Secretoglobin family 2B member 2, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scgb2b2Q6UGQ3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scgb2b2Q6UGQ3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scgb2b2Q6UGQ3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scgb2b2Q6UGQ3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scgb2b2Q6UGQ3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scgb2b2Q6UGQ3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scgb2b2Q6UGQ3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scgb2b2Q6UGQ3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scgb2b2Q6UGQ3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Scgb2b2Q6UGQ3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scgb2b2Q6UGQ3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scgb2b2Q6UGQ3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scgb2b2Q6UGQ3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scgb2b2Q6UGQ3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scgb2b2Q6UGQ3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scgb2b2Q6UGQ3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scgb2b2Q6UGQ3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scgb2b2Q6UGQ3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scgb2b2Q6UGQ3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scgb2b2Q6UGQ3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scgb2b2Q6UGQ3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scgb2b2Q6UGQ3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scgb2b2Q6UGQ3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scgb2b2Q6UGQ3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scgb2b2Q6UGQ3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scgb2b2Q6UGQ3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scgb2b2Q6UGQ3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scgb2b2Q6UGQ3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scgb2b2Q6UGQ3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scgb2b2Q6UGQ3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scgb2b2Q6UGQ3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scgb2b2Q6UGQ3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scgb2b2Q6UGQ3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scgb2b2Q6UGQ3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scgb2b2Q6UGQ3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scgb2b2Q6UGQ3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scgb2b2Q6UGQ3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scgb2b2Q6UGQ3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scgb2b2Q6UGQ3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scgb2b2Q6UGQ3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scgb2b2Q6UGQ3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scgb2b2Q6UGQ3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scgb2b2Q6UGQ3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scgb2b2Q6UGQ3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scgb2b2Q6UGQ3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scgb2b2Q6UGQ3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scgb2b2Q6UGQ3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scgb2b2Q6UGQ3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scgb2b2Q6UGQ3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Scgb2b2Q6UGQ3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scgb2b2Q6UGQ3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scgb2b2Q6UGQ3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scgb2b2Q6UGQ3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scgb2b2Q6UGQ3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scgb2b2Q6UGQ3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scgb2b2Q6UGQ3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scgb2b2Q6UGQ3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scgb2b2Q6UGQ3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scgb2b2Q6UGQ3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scgb2b2Q6UGQ3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Scgb2b2Q6UGQ3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Scgb2b2Q6UGQ3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Scgb2b2Q6UGQ3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scgb2b2Q6UGQ3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scgb2b2Q6UGQ3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scgb2b2Q6UGQ3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scgb2b2Q6UGQ3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scgb2b2Q6UGQ3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scgb2b2Q6UGQ3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scgb2b2Q6UGQ3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scgb2b2Q6UGQ3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scgb2b2Q6UGQ3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scgb2b2Q6UGQ3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scgb2b2Q6UGQ3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scgb2b2Q6UGQ3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Scgb2b2Q6UGQ3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Scgb2b2Q6UGQ3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scgb2b2Q6UGQ3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scgb2b2Q6UGQ3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scgb2b2Q6UGQ3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scgb2b2Q6UGQ3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scgb2b2Q6UGQ3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scgb2b2Q6UGQ3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scgb2b2Q6UGQ3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scgb2b2Q6UGQ3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scgb2b2Q6UGQ3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scgb2b2Q6UGQ3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scgb2b2Q6UGQ3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scgb2b2Q6UGQ3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scgb2b2Q6UGQ3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scgb2b2Q6UGQ3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scgb2b2Q6UGQ3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scgb2b2Q6UGQ3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scgb2b2Q6UGQ3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scgb2b2Q6UGQ3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scgb2b2Q6UGQ3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scgb2b2Q6UGQ3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scgb2b2Q6UGQ3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scgb2b2Q6UGQ3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scgb2b2Q6UGQ3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms