Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q473

Clca4a, Calcium-activated chloride channel regulator 4A, mousemouse

Predictions only

Length 924 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca4aQ6Q473 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clca4aQ6Q473 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clca4aQ6Q473 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clca4aQ6Q473 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clca4aQ6Q473 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clca4aQ6Q473 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Clca4aQ6Q473 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Clca4aQ6Q473 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Clca4aQ6Q473 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Clca4aQ6Q473 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Clca4aQ6Q473 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Clca4aQ6Q473 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Clca4aQ6Q473 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Clca4aQ6Q473 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Clca4aQ6Q473 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Clca4aQ6Q473 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Clca4aQ6Q473 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Clca4aQ6Q473 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Clca4aQ6Q473 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Clca4aQ6Q473 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Clca4aQ6Q473 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Clca4aQ6Q473 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Clca4aQ6Q473 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Clca4aQ6Q473 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clca4aQ6Q473 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clca4aQ6Q473 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clca4aQ6Q473 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clca4aQ6Q473 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Clca4aQ6Q473 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Clca4aQ6Q473 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Clca4aQ6Q473 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Clca4aQ6Q473 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Clca4aQ6Q473 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Clca4aQ6Q473 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Clca4aQ6Q473 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Clca4aQ6Q473 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Clca4aQ6Q473 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Clca4aQ6Q473 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Clca4aQ6Q473 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Clca4aQ6Q473 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Clca4aQ6Q473 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Clca4aQ6Q473 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clca4aQ6Q473 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clca4aQ6Q473 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clca4aQ6Q473 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clca4aQ6Q473 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clca4aQ6Q473 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clca4aQ6Q473 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clca4aQ6Q473 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clca4aQ6Q473 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clca4aQ6Q473 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clca4aQ6Q473 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clca4aQ6Q473 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clca4aQ6Q473 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Clca4aQ6Q473 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Clca4aQ6Q473 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Clca4aQ6Q473 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Clca4aQ6Q473 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clca4aQ6Q473 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clca4aQ6Q473 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clca4aQ6Q473 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clca4aQ6Q473 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clca4aQ6Q473 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clca4aQ6Q473 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clca4aQ6Q473 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Clca4aQ6Q473 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Clca4aQ6Q473 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Clca4aQ6Q473 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Clca4aQ6Q473 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Clca4aQ6Q473 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Clca4aQ6Q473 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clca4aQ6Q473 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clca4aQ6Q473 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clca4aQ6Q473 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clca4aQ6Q473 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clca4aQ6Q473 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clca4aQ6Q473 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clca4aQ6Q473 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clca4aQ6Q473 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clca4aQ6Q473 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clca4aQ6Q473 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clca4aQ6Q473 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clca4aQ6Q473 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clca4aQ6Q473 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Clca4aQ6Q473 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Clca4aQ6Q473 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Clca4aQ6Q473 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Clca4aQ6Q473 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Clca4aQ6Q473 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Clca4aQ6Q473 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Clca4aQ6Q473 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Clca4aQ6Q473 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Clca4aQ6Q473 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Clca4aQ6Q473 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Clca4aQ6Q473 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Clca4aQ6Q473 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Clca4aQ6Q473 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Clca4aQ6Q473 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Clca4aQ6Q473 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Clca4aQ6Q473 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms