Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEM8

Slc46a1, Proton-coupled folate transporter, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc46a1Q6PEM8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc46a1Q6PEM8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc46a1Q6PEM8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc46a1Q6PEM8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc46a1Q6PEM8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc46a1Q6PEM8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc46a1Q6PEM8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc46a1Q6PEM8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc46a1Q6PEM8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc46a1Q6PEM8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc46a1Q6PEM8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc46a1Q6PEM8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc46a1Q6PEM8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc46a1Q6PEM8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Slc46a1Q6PEM8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc46a1Q6PEM8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc46a1Q6PEM8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc46a1Q6PEM8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc46a1Q6PEM8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc46a1Q6PEM8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc46a1Q6PEM8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc46a1Q6PEM8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc46a1Q6PEM8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc46a1Q6PEM8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc46a1Q6PEM8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc46a1Q6PEM8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc46a1Q6PEM8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc46a1Q6PEM8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc46a1Q6PEM8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc46a1Q6PEM8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc46a1Q6PEM8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc46a1Q6PEM8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc46a1Q6PEM8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc46a1Q6PEM8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc46a1Q6PEM8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc46a1Q6PEM8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc46a1Q6PEM8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc46a1Q6PEM8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc46a1Q6PEM8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc46a1Q6PEM8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc46a1Q6PEM8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc46a1Q6PEM8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc46a1Q6PEM8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc46a1Q6PEM8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc46a1Q6PEM8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc46a1Q6PEM8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc46a1Q6PEM8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc46a1Q6PEM8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc46a1Q6PEM8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc46a1Q6PEM8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc46a1Q6PEM8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc46a1Q6PEM8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc46a1Q6PEM8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc46a1Q6PEM8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc46a1Q6PEM8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc46a1Q6PEM8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc46a1Q6PEM8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc46a1Q6PEM8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc46a1Q6PEM8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc46a1Q6PEM8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc46a1Q6PEM8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc46a1Q6PEM8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc46a1Q6PEM8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc46a1Q6PEM8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc46a1Q6PEM8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc46a1Q6PEM8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc46a1Q6PEM8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc46a1Q6PEM8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc46a1Q6PEM8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc46a1Q6PEM8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc46a1Q6PEM8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc46a1Q6PEM8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc46a1Q6PEM8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc46a1Q6PEM8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc46a1Q6PEM8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc46a1Q6PEM8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc46a1Q6PEM8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc46a1Q6PEM8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc46a1Q6PEM8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc46a1Q6PEM8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc46a1Q6PEM8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc46a1Q6PEM8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc46a1Q6PEM8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc46a1Q6PEM8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc46a1Q6PEM8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc46a1Q6PEM8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc46a1Q6PEM8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc46a1Q6PEM8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc46a1Q6PEM8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc46a1Q6PEM8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc46a1Q6PEM8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc46a1Q6PEM8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc46a1Q6PEM8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc46a1Q6PEM8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc46a1Q6PEM8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc46a1Q6PEM8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc46a1Q6PEM8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc46a1Q6PEM8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc46a1Q6PEM8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc46a1Q6PEM8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 217.2 ms