Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS0

Vstm2l, V-set and transmembrane domain-containing protein 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2lQ6PDS0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vstm2lQ6PDS0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vstm2lQ6PDS0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vstm2lQ6PDS0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vstm2lQ6PDS0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Vstm2lQ6PDS0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vstm2lQ6PDS0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vstm2lQ6PDS0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vstm2lQ6PDS0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vstm2lQ6PDS0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vstm2lQ6PDS0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vstm2lQ6PDS0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vstm2lQ6PDS0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vstm2lQ6PDS0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vstm2lQ6PDS0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vstm2lQ6PDS0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vstm2lQ6PDS0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vstm2lQ6PDS0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vstm2lQ6PDS0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vstm2lQ6PDS0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vstm2lQ6PDS0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vstm2lQ6PDS0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vstm2lQ6PDS0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vstm2lQ6PDS0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vstm2lQ6PDS0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vstm2lQ6PDS0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vstm2lQ6PDS0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vstm2lQ6PDS0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vstm2lQ6PDS0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vstm2lQ6PDS0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vstm2lQ6PDS0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vstm2lQ6PDS0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vstm2lQ6PDS0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vstm2lQ6PDS0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vstm2lQ6PDS0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vstm2lQ6PDS0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Vstm2lQ6PDS0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vstm2lQ6PDS0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Vstm2lQ6PDS0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vstm2lQ6PDS0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vstm2lQ6PDS0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vstm2lQ6PDS0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vstm2lQ6PDS0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Vstm2lQ6PDS0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vstm2lQ6PDS0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vstm2lQ6PDS0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vstm2lQ6PDS0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vstm2lQ6PDS0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Vstm2lQ6PDS0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vstm2lQ6PDS0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vstm2lQ6PDS0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vstm2lQ6PDS0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vstm2lQ6PDS0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vstm2lQ6PDS0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vstm2lQ6PDS0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vstm2lQ6PDS0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vstm2lQ6PDS0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Vstm2lQ6PDS0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vstm2lQ6PDS0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vstm2lQ6PDS0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vstm2lQ6PDS0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vstm2lQ6PDS0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vstm2lQ6PDS0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vstm2lQ6PDS0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vstm2lQ6PDS0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vstm2lQ6PDS0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vstm2lQ6PDS0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vstm2lQ6PDS0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vstm2lQ6PDS0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vstm2lQ6PDS0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vstm2lQ6PDS0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vstm2lQ6PDS0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vstm2lQ6PDS0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vstm2lQ6PDS0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vstm2lQ6PDS0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vstm2lQ6PDS0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vstm2lQ6PDS0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vstm2lQ6PDS0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vstm2lQ6PDS0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vstm2lQ6PDS0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vstm2lQ6PDS0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Vstm2lQ6PDS0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vstm2lQ6PDS0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vstm2lQ6PDS0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vstm2lQ6PDS0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vstm2lQ6PDS0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vstm2lQ6PDS0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vstm2lQ6PDS0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vstm2lQ6PDS0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vstm2lQ6PDS0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vstm2lQ6PDS0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vstm2lQ6PDS0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Vstm2lQ6PDS0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vstm2lQ6PDS0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vstm2lQ6PDS0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vstm2lQ6PDS0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vstm2lQ6PDS0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vstm2lQ6PDS0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vstm2lQ6PDS0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vstm2lQ6PDS0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms