Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDM4

Ccdc36, Interactor of HORMAD1 protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc36Q6PDM4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc36Q6PDM4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc36Q6PDM4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc36Q6PDM4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc36Q6PDM4 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc36Q6PDM4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc36Q6PDM4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc36Q6PDM4 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc36Q6PDM4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc36Q6PDM4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc36Q6PDM4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc36Q6PDM4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc36Q6PDM4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc36Q6PDM4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc36Q6PDM4 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc36Q6PDM4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc36Q6PDM4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc36Q6PDM4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc36Q6PDM4 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc36Q6PDM4 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc36Q6PDM4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc36Q6PDM4 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc36Q6PDM4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc36Q6PDM4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc36Q6PDM4 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc36Q6PDM4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc36Q6PDM4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc36Q6PDM4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc36Q6PDM4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc36Q6PDM4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc36Q6PDM4 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc36Q6PDM4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc36Q6PDM4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc36Q6PDM4 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc36Q6PDM4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc36Q6PDM4 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc36Q6PDM4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc36Q6PDM4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc36Q6PDM4 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc36Q6PDM4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc36Q6PDM4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc36Q6PDM4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc36Q6PDM4 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc36Q6PDM4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc36Q6PDM4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc36Q6PDM4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc36Q6PDM4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc36Q6PDM4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc36Q6PDM4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc36Q6PDM4 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc36Q6PDM4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc36Q6PDM4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc36Q6PDM4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc36Q6PDM4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc36Q6PDM4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc36Q6PDM4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc36Q6PDM4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc36Q6PDM4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc36Q6PDM4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc36Q6PDM4 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc36Q6PDM4 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc36Q6PDM4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc36Q6PDM4 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc36Q6PDM4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc36Q6PDM4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc36Q6PDM4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc36Q6PDM4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc36Q6PDM4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc36Q6PDM4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc36Q6PDM4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc36Q6PDM4 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc36Q6PDM4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc36Q6PDM4 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc36Q6PDM4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc36Q6PDM4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc36Q6PDM4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc36Q6PDM4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc36Q6PDM4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc36Q6PDM4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc36Q6PDM4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc36Q6PDM4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc36Q6PDM4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc36Q6PDM4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc36Q6PDM4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc36Q6PDM4 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc36Q6PDM4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc36Q6PDM4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc36Q6PDM4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc36Q6PDM4 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc36Q6PDM4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc36Q6PDM4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc36Q6PDM4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc36Q6PDM4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc36Q6PDM4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc36Q6PDM4 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc36Q6PDM4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc36Q6PDM4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc36Q6PDM4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc36Q6PDM4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc36Q6PDM4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms