Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX9

Trim37, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM37, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim37Q6PCX9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim37Q6PCX9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim37Q6PCX9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim37Q6PCX9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim37Q6PCX9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim37Q6PCX9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim37Q6PCX9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim37Q6PCX9 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim37Q6PCX9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim37Q6PCX9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim37Q6PCX9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim37Q6PCX9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim37Q6PCX9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim37Q6PCX9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim37Q6PCX9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim37Q6PCX9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim37Q6PCX9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim37Q6PCX9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim37Q6PCX9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim37Q6PCX9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim37Q6PCX9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim37Q6PCX9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim37Q6PCX9 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim37Q6PCX9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim37Q6PCX9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim37Q6PCX9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim37Q6PCX9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim37Q6PCX9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim37Q6PCX9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim37Q6PCX9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim37Q6PCX9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim37Q6PCX9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim37Q6PCX9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim37Q6PCX9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim37Q6PCX9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim37Q6PCX9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim37Q6PCX9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim37Q6PCX9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim37Q6PCX9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim37Q6PCX9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim37Q6PCX9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim37Q6PCX9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim37Q6PCX9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim37Q6PCX9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim37Q6PCX9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim37Q6PCX9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim37Q6PCX9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim37Q6PCX9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim37Q6PCX9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim37Q6PCX9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim37Q6PCX9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim37Q6PCX9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim37Q6PCX9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim37Q6PCX9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim37Q6PCX9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim37Q6PCX9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim37Q6PCX9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim37Q6PCX9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim37Q6PCX9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim37Q6PCX9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim37Q6PCX9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim37Q6PCX9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim37Q6PCX9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim37Q6PCX9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim37Q6PCX9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim37Q6PCX9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim37Q6PCX9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim37Q6PCX9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim37Q6PCX9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim37Q6PCX9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim37Q6PCX9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim37Q6PCX9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim37Q6PCX9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim37Q6PCX9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim37Q6PCX9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim37Q6PCX9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim37Q6PCX9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim37Q6PCX9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim37Q6PCX9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim37Q6PCX9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim37Q6PCX9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim37Q6PCX9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim37Q6PCX9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim37Q6PCX9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim37Q6PCX9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim37Q6PCX9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim37Q6PCX9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim37Q6PCX9 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim37Q6PCX9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim37Q6PCX9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim37Q6PCX9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim37Q6PCX9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim37Q6PCX9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim37Q6PCX9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim37Q6PCX9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim37Q6PCX9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim37Q6PCX9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim37Q6PCX9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim37Q6PCX9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim37Q6PCX9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.5 ms