Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB51

Ccdc117, Coiled-coil domain-containing protein 117, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc117Q6PB51 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc117Q6PB51 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc117Q6PB51 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc117Q6PB51 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc117Q6PB51 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc117Q6PB51 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc117Q6PB51 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc117Q6PB51 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc117Q6PB51 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc117Q6PB51 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc117Q6PB51 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc117Q6PB51 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc117Q6PB51 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc117Q6PB51 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc117Q6PB51 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc117Q6PB51 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc117Q6PB51 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc117Q6PB51 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc117Q6PB51 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc117Q6PB51 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc117Q6PB51 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc117Q6PB51 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc117Q6PB51 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc117Q6PB51 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc117Q6PB51 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc117Q6PB51 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc117Q6PB51 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc117Q6PB51 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc117Q6PB51 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc117Q6PB51 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc117Q6PB51 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc117Q6PB51 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc117Q6PB51 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc117Q6PB51 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc117Q6PB51 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc117Q6PB51 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc117Q6PB51 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc117Q6PB51 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc117Q6PB51 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc117Q6PB51 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc117Q6PB51 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc117Q6PB51 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc117Q6PB51 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc117Q6PB51 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc117Q6PB51 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc117Q6PB51 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc117Q6PB51 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc117Q6PB51 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc117Q6PB51 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc117Q6PB51 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc117Q6PB51 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc117Q6PB51 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc117Q6PB51 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc117Q6PB51 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc117Q6PB51 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc117Q6PB51 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc117Q6PB51 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc117Q6PB51 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc117Q6PB51 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc117Q6PB51 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc117Q6PB51 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc117Q6PB51 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc117Q6PB51 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc117Q6PB51 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc117Q6PB51 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc117Q6PB51 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc117Q6PB51 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc117Q6PB51 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc117Q6PB51 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc117Q6PB51 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc117Q6PB51 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc117Q6PB51 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc117Q6PB51 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc117Q6PB51 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc117Q6PB51 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc117Q6PB51 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc117Q6PB51 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc117Q6PB51 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc117Q6PB51 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc117Q6PB51 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc117Q6PB51 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc117Q6PB51 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc117Q6PB51 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc117Q6PB51 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc117Q6PB51 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc117Q6PB51 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc117Q6PB51 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc117Q6PB51 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc117Q6PB51 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc117Q6PB51 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc117Q6PB51 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc117Q6PB51 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc117Q6PB51 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc117Q6PB51 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc117Q6PB51 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc117Q6PB51 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc117Q6PB51 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc117Q6PB51 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc117Q6PB51 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc117Q6PB51 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms