Protein–RNA interactions for Protein: Q6PA06

Atl2, Atlastin-2, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl2Q6PA06 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atl2Q6PA06 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atl2Q6PA06 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atl2Q6PA06 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atl2Q6PA06 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atl2Q6PA06 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atl2Q6PA06 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atl2Q6PA06 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atl2Q6PA06 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atl2Q6PA06 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atl2Q6PA06 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atl2Q6PA06 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atl2Q6PA06 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atl2Q6PA06 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atl2Q6PA06 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Atl2Q6PA06 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atl2Q6PA06 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atl2Q6PA06 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Atl2Q6PA06 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atl2Q6PA06 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atl2Q6PA06 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atl2Q6PA06 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atl2Q6PA06 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atl2Q6PA06 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atl2Q6PA06 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atl2Q6PA06 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atl2Q6PA06 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atl2Q6PA06 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atl2Q6PA06 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atl2Q6PA06 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atl2Q6PA06 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atl2Q6PA06 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atl2Q6PA06 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atl2Q6PA06 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atl2Q6PA06 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atl2Q6PA06 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atl2Q6PA06 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atl2Q6PA06 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atl2Q6PA06 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atl2Q6PA06 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atl2Q6PA06 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atl2Q6PA06 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atl2Q6PA06 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atl2Q6PA06 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atl2Q6PA06 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Atl2Q6PA06 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atl2Q6PA06 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atl2Q6PA06 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atl2Q6PA06 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atl2Q6PA06 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atl2Q6PA06 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atl2Q6PA06 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atl2Q6PA06 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Atl2Q6PA06 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atl2Q6PA06 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atl2Q6PA06 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Atl2Q6PA06 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atl2Q6PA06 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atl2Q6PA06 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atl2Q6PA06 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atl2Q6PA06 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atl2Q6PA06 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atl2Q6PA06 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atl2Q6PA06 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atl2Q6PA06 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atl2Q6PA06 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atl2Q6PA06 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atl2Q6PA06 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atl2Q6PA06 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atl2Q6PA06 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atl2Q6PA06 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atl2Q6PA06 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atl2Q6PA06 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atl2Q6PA06 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atl2Q6PA06 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atl2Q6PA06 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atl2Q6PA06 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atl2Q6PA06 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atl2Q6PA06 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atl2Q6PA06 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atl2Q6PA06 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atl2Q6PA06 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atl2Q6PA06 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atl2Q6PA06 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atl2Q6PA06 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atl2Q6PA06 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atl2Q6PA06 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atl2Q6PA06 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atl2Q6PA06 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atl2Q6PA06 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atl2Q6PA06 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atl2Q6PA06 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atl2Q6PA06 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atl2Q6PA06 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atl2Q6PA06 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atl2Q6PA06 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atl2Q6PA06 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atl2Q6PA06 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atl2Q6PA06 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atl2Q6PA06 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms