Protein–RNA interactions for Protein: Q6P539

Fam222b, Protein FAM222B, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam222bQ6P539 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fam222bQ6P539 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam222bQ6P539 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam222bQ6P539 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam222bQ6P539 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam222bQ6P539 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam222bQ6P539 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam222bQ6P539 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam222bQ6P539 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam222bQ6P539 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam222bQ6P539 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam222bQ6P539 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam222bQ6P539 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam222bQ6P539 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam222bQ6P539 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam222bQ6P539 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam222bQ6P539 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam222bQ6P539 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam222bQ6P539 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam222bQ6P539 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam222bQ6P539 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam222bQ6P539 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam222bQ6P539 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam222bQ6P539 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam222bQ6P539 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam222bQ6P539 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam222bQ6P539 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam222bQ6P539 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam222bQ6P539 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam222bQ6P539 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam222bQ6P539 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam222bQ6P539 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam222bQ6P539 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam222bQ6P539 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam222bQ6P539 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam222bQ6P539 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam222bQ6P539 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam222bQ6P539 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam222bQ6P539 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam222bQ6P539 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam222bQ6P539 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fam222bQ6P539 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fam222bQ6P539 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fam222bQ6P539 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fam222bQ6P539 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fam222bQ6P539 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fam222bQ6P539 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fam222bQ6P539 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fam222bQ6P539 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fam222bQ6P539 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam222bQ6P539 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam222bQ6P539 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam222bQ6P539 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam222bQ6P539 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam222bQ6P539 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam222bQ6P539 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam222bQ6P539 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam222bQ6P539 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam222bQ6P539 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam222bQ6P539 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam222bQ6P539 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam222bQ6P539 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam222bQ6P539 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam222bQ6P539 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam222bQ6P539 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam222bQ6P539 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam222bQ6P539 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam222bQ6P539 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam222bQ6P539 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam222bQ6P539 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam222bQ6P539 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam222bQ6P539 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam222bQ6P539 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam222bQ6P539 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam222bQ6P539 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam222bQ6P539 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam222bQ6P539 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam222bQ6P539 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam222bQ6P539 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam222bQ6P539 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam222bQ6P539 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam222bQ6P539 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam222bQ6P539 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam222bQ6P539 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam222bQ6P539 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam222bQ6P539 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam222bQ6P539 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam222bQ6P539 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam222bQ6P539 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam222bQ6P539 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam222bQ6P539 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam222bQ6P539 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam222bQ6P539 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam222bQ6P539 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam222bQ6P539 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam222bQ6P539 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam222bQ6P539 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam222bQ6P539 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam222bQ6P539 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam222bQ6P539 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms