Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4S6

Sik3, Serine/threonine-protein kinase SIK3, mousemouse

Predictions only

Length 1,311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sik3Q6P4S6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sik3Q6P4S6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sik3Q6P4S6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Sik3Q6P4S6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sik3Q6P4S6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sik3Q6P4S6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sik3Q6P4S6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sik3Q6P4S6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sik3Q6P4S6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sik3Q6P4S6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sik3Q6P4S6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sik3Q6P4S6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sik3Q6P4S6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Sik3Q6P4S6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sik3Q6P4S6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sik3Q6P4S6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sik3Q6P4S6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sik3Q6P4S6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Sik3Q6P4S6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sik3Q6P4S6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sik3Q6P4S6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sik3Q6P4S6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sik3Q6P4S6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sik3Q6P4S6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sik3Q6P4S6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sik3Q6P4S6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sik3Q6P4S6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sik3Q6P4S6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sik3Q6P4S6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sik3Q6P4S6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sik3Q6P4S6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sik3Q6P4S6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sik3Q6P4S6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sik3Q6P4S6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sik3Q6P4S6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sik3Q6P4S6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sik3Q6P4S6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sik3Q6P4S6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sik3Q6P4S6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sik3Q6P4S6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Sik3Q6P4S6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sik3Q6P4S6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sik3Q6P4S6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sik3Q6P4S6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sik3Q6P4S6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sik3Q6P4S6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sik3Q6P4S6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Sik3Q6P4S6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sik3Q6P4S6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sik3Q6P4S6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sik3Q6P4S6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sik3Q6P4S6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sik3Q6P4S6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sik3Q6P4S6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sik3Q6P4S6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Sik3Q6P4S6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sik3Q6P4S6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sik3Q6P4S6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sik3Q6P4S6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sik3Q6P4S6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sik3Q6P4S6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sik3Q6P4S6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sik3Q6P4S6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sik3Q6P4S6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Sik3Q6P4S6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sik3Q6P4S6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sik3Q6P4S6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sik3Q6P4S6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sik3Q6P4S6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sik3Q6P4S6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sik3Q6P4S6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sik3Q6P4S6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sik3Q6P4S6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sik3Q6P4S6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sik3Q6P4S6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sik3Q6P4S6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sik3Q6P4S6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sik3Q6P4S6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sik3Q6P4S6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sik3Q6P4S6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sik3Q6P4S6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Sik3Q6P4S6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Sik3Q6P4S6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sik3Q6P4S6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sik3Q6P4S6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sik3Q6P4S6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sik3Q6P4S6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sik3Q6P4S6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sik3Q6P4S6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sik3Q6P4S6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sik3Q6P4S6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sik3Q6P4S6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sik3Q6P4S6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Sik3Q6P4S6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sik3Q6P4S6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sik3Q6P4S6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sik3Q6P4S6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sik3Q6P4S6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sik3Q6P4S6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sik3Q6P4S6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms