Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3E7

Hdac10, Histone deacetylase 10, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac10Q6P3E7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hdac10Q6P3E7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hdac10Q6P3E7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hdac10Q6P3E7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hdac10Q6P3E7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hdac10Q6P3E7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Hdac10Q6P3E7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hdac10Q6P3E7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hdac10Q6P3E7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hdac10Q6P3E7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hdac10Q6P3E7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hdac10Q6P3E7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hdac10Q6P3E7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Hdac10Q6P3E7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Hdac10Q6P3E7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hdac10Q6P3E7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hdac10Q6P3E7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hdac10Q6P3E7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hdac10Q6P3E7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hdac10Q6P3E7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hdac10Q6P3E7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hdac10Q6P3E7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hdac10Q6P3E7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hdac10Q6P3E7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hdac10Q6P3E7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hdac10Q6P3E7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hdac10Q6P3E7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hdac10Q6P3E7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Hdac10Q6P3E7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hdac10Q6P3E7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Hdac10Q6P3E7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hdac10Q6P3E7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hdac10Q6P3E7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hdac10Q6P3E7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hdac10Q6P3E7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hdac10Q6P3E7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hdac10Q6P3E7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hdac10Q6P3E7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hdac10Q6P3E7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hdac10Q6P3E7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hdac10Q6P3E7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hdac10Q6P3E7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Hdac10Q6P3E7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hdac10Q6P3E7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hdac10Q6P3E7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hdac10Q6P3E7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hdac10Q6P3E7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Hdac10Q6P3E7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hdac10Q6P3E7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hdac10Q6P3E7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hdac10Q6P3E7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hdac10Q6P3E7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hdac10Q6P3E7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hdac10Q6P3E7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hdac10Q6P3E7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hdac10Q6P3E7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hdac10Q6P3E7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hdac10Q6P3E7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hdac10Q6P3E7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hdac10Q6P3E7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Hdac10Q6P3E7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Hdac10Q6P3E7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hdac10Q6P3E7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hdac10Q6P3E7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hdac10Q6P3E7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hdac10Q6P3E7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hdac10Q6P3E7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hdac10Q6P3E7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hdac10Q6P3E7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hdac10Q6P3E7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hdac10Q6P3E7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hdac10Q6P3E7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hdac10Q6P3E7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hdac10Q6P3E7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Hdac10Q6P3E7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hdac10Q6P3E7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Hdac10Q6P3E7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hdac10Q6P3E7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hdac10Q6P3E7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hdac10Q6P3E7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hdac10Q6P3E7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hdac10Q6P3E7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hdac10Q6P3E7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Hdac10Q6P3E7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hdac10Q6P3E7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hdac10Q6P3E7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hdac10Q6P3E7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hdac10Q6P3E7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hdac10Q6P3E7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hdac10Q6P3E7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hdac10Q6P3E7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hdac10Q6P3E7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hdac10Q6P3E7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hdac10Q6P3E7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hdac10Q6P3E7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hdac10Q6P3E7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hdac10Q6P3E7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hdac10Q6P3E7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hdac10Q6P3E7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hdac10Q6P3E7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms