Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2K6

Ppp4r3a, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 3A, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4r3aQ6P2K6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ppp4r3aQ6P2K6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ppp4r3aQ6P2K6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ppp4r3aQ6P2K6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ppp4r3aQ6P2K6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ppp4r3aQ6P2K6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ppp4r3aQ6P2K6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ppp4r3aQ6P2K6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ppp4r3aQ6P2K6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ppp4r3aQ6P2K6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ppp4r3aQ6P2K6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ppp4r3aQ6P2K6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ppp4r3aQ6P2K6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ppp4r3aQ6P2K6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ppp4r3aQ6P2K6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ppp4r3aQ6P2K6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ppp4r3aQ6P2K6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ppp4r3aQ6P2K6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ppp4r3aQ6P2K6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ppp4r3aQ6P2K6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ppp4r3aQ6P2K6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Ppp4r3aQ6P2K6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ppp4r3aQ6P2K6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ppp4r3aQ6P2K6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ppp4r3aQ6P2K6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ppp4r3aQ6P2K6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ppp4r3aQ6P2K6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ppp4r3aQ6P2K6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ppp4r3aQ6P2K6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ppp4r3aQ6P2K6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ppp4r3aQ6P2K6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ppp4r3aQ6P2K6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ppp4r3aQ6P2K6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ppp4r3aQ6P2K6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ppp4r3aQ6P2K6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ppp4r3aQ6P2K6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ppp4r3aQ6P2K6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ppp4r3aQ6P2K6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ppp4r3aQ6P2K6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ppp4r3aQ6P2K6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ppp4r3aQ6P2K6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ppp4r3aQ6P2K6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ppp4r3aQ6P2K6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ppp4r3aQ6P2K6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ppp4r3aQ6P2K6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ppp4r3aQ6P2K6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ppp4r3aQ6P2K6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ppp4r3aQ6P2K6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ppp4r3aQ6P2K6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ppp4r3aQ6P2K6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ppp4r3aQ6P2K6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ppp4r3aQ6P2K6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ppp4r3aQ6P2K6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ppp4r3aQ6P2K6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ppp4r3aQ6P2K6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ppp4r3aQ6P2K6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ppp4r3aQ6P2K6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ppp4r3aQ6P2K6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ppp4r3aQ6P2K6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ppp4r3aQ6P2K6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ppp4r3aQ6P2K6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ppp4r3aQ6P2K6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ppp4r3aQ6P2K6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ppp4r3aQ6P2K6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ppp4r3aQ6P2K6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ppp4r3aQ6P2K6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ppp4r3aQ6P2K6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ppp4r3aQ6P2K6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ppp4r3aQ6P2K6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ppp4r3aQ6P2K6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ppp4r3aQ6P2K6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ppp4r3aQ6P2K6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ppp4r3aQ6P2K6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ppp4r3aQ6P2K6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Ppp4r3aQ6P2K6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ppp4r3aQ6P2K6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ppp4r3aQ6P2K6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ppp4r3aQ6P2K6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ppp4r3aQ6P2K6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ppp4r3aQ6P2K6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ppp4r3aQ6P2K6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Ppp4r3aQ6P2K6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ppp4r3aQ6P2K6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ppp4r3aQ6P2K6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ppp4r3aQ6P2K6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ppp4r3aQ6P2K6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ppp4r3aQ6P2K6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ppp4r3aQ6P2K6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ppp4r3aQ6P2K6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ppp4r3aQ6P2K6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ppp4r3aQ6P2K6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ppp4r3aQ6P2K6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms