Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZQ0

Ccdc189, Coiled-coil domain-containing protein 189, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc189Q6NZQ0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc189Q6NZQ0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc189Q6NZQ0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc189Q6NZQ0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc189Q6NZQ0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc189Q6NZQ0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc189Q6NZQ0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc189Q6NZQ0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc189Q6NZQ0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc189Q6NZQ0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc189Q6NZQ0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc189Q6NZQ0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc189Q6NZQ0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc189Q6NZQ0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc189Q6NZQ0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ccdc189Q6NZQ0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ccdc189Q6NZQ0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ccdc189Q6NZQ0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ccdc189Q6NZQ0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc189Q6NZQ0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc189Q6NZQ0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc189Q6NZQ0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc189Q6NZQ0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc189Q6NZQ0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc189Q6NZQ0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc189Q6NZQ0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc189Q6NZQ0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc189Q6NZQ0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc189Q6NZQ0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc189Q6NZQ0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc189Q6NZQ0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc189Q6NZQ0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc189Q6NZQ0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc189Q6NZQ0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc189Q6NZQ0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc189Q6NZQ0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc189Q6NZQ0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc189Q6NZQ0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc189Q6NZQ0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc189Q6NZQ0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc189Q6NZQ0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc189Q6NZQ0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc189Q6NZQ0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc189Q6NZQ0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc189Q6NZQ0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc189Q6NZQ0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc189Q6NZQ0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc189Q6NZQ0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc189Q6NZQ0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc189Q6NZQ0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc189Q6NZQ0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc189Q6NZQ0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc189Q6NZQ0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc189Q6NZQ0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc189Q6NZQ0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc189Q6NZQ0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc189Q6NZQ0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc189Q6NZQ0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc189Q6NZQ0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc189Q6NZQ0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc189Q6NZQ0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc189Q6NZQ0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc189Q6NZQ0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc189Q6NZQ0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc189Q6NZQ0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc189Q6NZQ0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc189Q6NZQ0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc189Q6NZQ0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc189Q6NZQ0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc189Q6NZQ0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc189Q6NZQ0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc189Q6NZQ0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc189Q6NZQ0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc189Q6NZQ0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc189Q6NZQ0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc189Q6NZQ0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc189Q6NZQ0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc189Q6NZQ0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc189Q6NZQ0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc189Q6NZQ0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc189Q6NZQ0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc189Q6NZQ0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc189Q6NZQ0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc189Q6NZQ0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc189Q6NZQ0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc189Q6NZQ0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc189Q6NZQ0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc189Q6NZQ0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc189Q6NZQ0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc189Q6NZQ0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc189Q6NZQ0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc189Q6NZQ0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc189Q6NZQ0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc189Q6NZQ0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc189Q6NZQ0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc189Q6NZQ0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccdc189Q6NZQ0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccdc189Q6NZQ0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc189Q6NZQ0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc189Q6NZQ0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 847.4 ms