Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZK8

Ptpdc1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpdc1Q6NZK8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ptpdc1Q6NZK8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ptpdc1Q6NZK8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ptpdc1Q6NZK8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ptpdc1Q6NZK8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ptpdc1Q6NZK8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ptpdc1Q6NZK8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ptpdc1Q6NZK8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ptpdc1Q6NZK8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ptpdc1Q6NZK8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ptpdc1Q6NZK8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ptpdc1Q6NZK8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ptpdc1Q6NZK8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ptpdc1Q6NZK8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ptpdc1Q6NZK8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ptpdc1Q6NZK8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ptpdc1Q6NZK8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ptpdc1Q6NZK8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ptpdc1Q6NZK8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ptpdc1Q6NZK8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ptpdc1Q6NZK8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ptpdc1Q6NZK8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ptpdc1Q6NZK8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Ptpdc1Q6NZK8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ptpdc1Q6NZK8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ptpdc1Q6NZK8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ptpdc1Q6NZK8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ptpdc1Q6NZK8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ptpdc1Q6NZK8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Ptpdc1Q6NZK8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ptpdc1Q6NZK8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ptpdc1Q6NZK8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ptpdc1Q6NZK8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Ptpdc1Q6NZK8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ptpdc1Q6NZK8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ptpdc1Q6NZK8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ptpdc1Q6NZK8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ptpdc1Q6NZK8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ptpdc1Q6NZK8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Ptpdc1Q6NZK8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ptpdc1Q6NZK8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ptpdc1Q6NZK8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ptpdc1Q6NZK8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ptpdc1Q6NZK8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ptpdc1Q6NZK8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ptpdc1Q6NZK8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ptpdc1Q6NZK8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ptpdc1Q6NZK8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ptpdc1Q6NZK8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ptpdc1Q6NZK8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ptpdc1Q6NZK8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ptpdc1Q6NZK8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ptpdc1Q6NZK8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ptpdc1Q6NZK8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ptpdc1Q6NZK8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Ptpdc1Q6NZK8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ptpdc1Q6NZK8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ptpdc1Q6NZK8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ptpdc1Q6NZK8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ptpdc1Q6NZK8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ptpdc1Q6NZK8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ptpdc1Q6NZK8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ptpdc1Q6NZK8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ptpdc1Q6NZK8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ptpdc1Q6NZK8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ptpdc1Q6NZK8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ptpdc1Q6NZK8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ptpdc1Q6NZK8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ptpdc1Q6NZK8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ptpdc1Q6NZK8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ptpdc1Q6NZK8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ptpdc1Q6NZK8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ptpdc1Q6NZK8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ptpdc1Q6NZK8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ptpdc1Q6NZK8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ptpdc1Q6NZK8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ptpdc1Q6NZK8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ptpdc1Q6NZK8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ptpdc1Q6NZK8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ptpdc1Q6NZK8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ptpdc1Q6NZK8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ptpdc1Q6NZK8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ptpdc1Q6NZK8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ptpdc1Q6NZK8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ptpdc1Q6NZK8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ptpdc1Q6NZK8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ptpdc1Q6NZK8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ptpdc1Q6NZK8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ptpdc1Q6NZK8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ptpdc1Q6NZK8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ptpdc1Q6NZK8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ptpdc1Q6NZK8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ptpdc1Q6NZK8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ptpdc1Q6NZK8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ptpdc1Q6NZK8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ptpdc1Q6NZK8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ptpdc1Q6NZK8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ptpdc1Q6NZK8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ptpdc1Q6NZK8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ptpdc1Q6NZK8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms