Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF4

Helb, DNA helicase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HelbQ6NVF4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HelbQ6NVF4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
HelbQ6NVF4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HelbQ6NVF4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HelbQ6NVF4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HelbQ6NVF4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HelbQ6NVF4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HelbQ6NVF4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HelbQ6NVF4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HelbQ6NVF4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HelbQ6NVF4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HelbQ6NVF4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HelbQ6NVF4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HelbQ6NVF4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HelbQ6NVF4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HelbQ6NVF4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HelbQ6NVF4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HelbQ6NVF4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HelbQ6NVF4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HelbQ6NVF4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HelbQ6NVF4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
HelbQ6NVF4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HelbQ6NVF4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HelbQ6NVF4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HelbQ6NVF4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HelbQ6NVF4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HelbQ6NVF4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HelbQ6NVF4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HelbQ6NVF4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HelbQ6NVF4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HelbQ6NVF4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HelbQ6NVF4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HelbQ6NVF4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HelbQ6NVF4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HelbQ6NVF4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HelbQ6NVF4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HelbQ6NVF4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HelbQ6NVF4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HelbQ6NVF4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HelbQ6NVF4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HelbQ6NVF4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HelbQ6NVF4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HelbQ6NVF4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HelbQ6NVF4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HelbQ6NVF4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HelbQ6NVF4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HelbQ6NVF4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HelbQ6NVF4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HelbQ6NVF4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HelbQ6NVF4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HelbQ6NVF4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HelbQ6NVF4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HelbQ6NVF4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HelbQ6NVF4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HelbQ6NVF4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HelbQ6NVF4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HelbQ6NVF4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HelbQ6NVF4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HelbQ6NVF4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HelbQ6NVF4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HelbQ6NVF4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HelbQ6NVF4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HelbQ6NVF4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HelbQ6NVF4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HelbQ6NVF4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HelbQ6NVF4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HelbQ6NVF4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HelbQ6NVF4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HelbQ6NVF4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HelbQ6NVF4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HelbQ6NVF4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HelbQ6NVF4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HelbQ6NVF4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HelbQ6NVF4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HelbQ6NVF4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HelbQ6NVF4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HelbQ6NVF4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HelbQ6NVF4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HelbQ6NVF4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HelbQ6NVF4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HelbQ6NVF4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HelbQ6NVF4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HelbQ6NVF4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HelbQ6NVF4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HelbQ6NVF4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HelbQ6NVF4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HelbQ6NVF4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HelbQ6NVF4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HelbQ6NVF4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HelbQ6NVF4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HelbQ6NVF4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HelbQ6NVF4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HelbQ6NVF4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HelbQ6NVF4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HelbQ6NVF4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HelbQ6NVF4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HelbQ6NVF4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HelbQ6NVF4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HelbQ6NVF4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HelbQ6NVF4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms