Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQV1

Fam196b, Protein FAM196B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam196bQ6GQV1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fam196bQ6GQV1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fam196bQ6GQV1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fam196bQ6GQV1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fam196bQ6GQV1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fam196bQ6GQV1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fam196bQ6GQV1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fam196bQ6GQV1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fam196bQ6GQV1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fam196bQ6GQV1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fam196bQ6GQV1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fam196bQ6GQV1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fam196bQ6GQV1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fam196bQ6GQV1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fam196bQ6GQV1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fam196bQ6GQV1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fam196bQ6GQV1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fam196bQ6GQV1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fam196bQ6GQV1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fam196bQ6GQV1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fam196bQ6GQV1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Fam196bQ6GQV1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Fam196bQ6GQV1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fam196bQ6GQV1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fam196bQ6GQV1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fam196bQ6GQV1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fam196bQ6GQV1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fam196bQ6GQV1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fam196bQ6GQV1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fam196bQ6GQV1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fam196bQ6GQV1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fam196bQ6GQV1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fam196bQ6GQV1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fam196bQ6GQV1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fam196bQ6GQV1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fam196bQ6GQV1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fam196bQ6GQV1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fam196bQ6GQV1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fam196bQ6GQV1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fam196bQ6GQV1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fam196bQ6GQV1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fam196bQ6GQV1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fam196bQ6GQV1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Fam196bQ6GQV1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fam196bQ6GQV1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fam196bQ6GQV1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fam196bQ6GQV1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fam196bQ6GQV1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fam196bQ6GQV1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fam196bQ6GQV1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fam196bQ6GQV1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fam196bQ6GQV1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fam196bQ6GQV1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fam196bQ6GQV1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fam196bQ6GQV1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fam196bQ6GQV1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fam196bQ6GQV1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fam196bQ6GQV1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fam196bQ6GQV1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fam196bQ6GQV1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fam196bQ6GQV1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fam196bQ6GQV1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fam196bQ6GQV1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fam196bQ6GQV1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Fam196bQ6GQV1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Fam196bQ6GQV1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fam196bQ6GQV1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fam196bQ6GQV1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fam196bQ6GQV1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam196bQ6GQV1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam196bQ6GQV1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam196bQ6GQV1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam196bQ6GQV1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam196bQ6GQV1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam196bQ6GQV1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam196bQ6GQV1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fam196bQ6GQV1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fam196bQ6GQV1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fam196bQ6GQV1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fam196bQ6GQV1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fam196bQ6GQV1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fam196bQ6GQV1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fam196bQ6GQV1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Fam196bQ6GQV1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fam196bQ6GQV1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fam196bQ6GQV1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fam196bQ6GQV1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fam196bQ6GQV1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fam196bQ6GQV1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fam196bQ6GQV1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fam196bQ6GQV1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Fam196bQ6GQV1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fam196bQ6GQV1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fam196bQ6GQV1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fam196bQ6GQV1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fam196bQ6GQV1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fam196bQ6GQV1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fam196bQ6GQV1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fam196bQ6GQV1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fam196bQ6GQV1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.4 ms