Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z26

Cntn4, Contactin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn4Q69Z26 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cntn4Q69Z26 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cntn4Q69Z26 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cntn4Q69Z26 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cntn4Q69Z26 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Cntn4Q69Z26 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cntn4Q69Z26 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cntn4Q69Z26 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cntn4Q69Z26 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cntn4Q69Z26 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cntn4Q69Z26 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cntn4Q69Z26 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cntn4Q69Z26 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cntn4Q69Z26 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cntn4Q69Z26 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Cntn4Q69Z26 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cntn4Q69Z26 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cntn4Q69Z26 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cntn4Q69Z26 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cntn4Q69Z26 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cntn4Q69Z26 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cntn4Q69Z26 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Cntn4Q69Z26 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Cntn4Q69Z26 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cntn4Q69Z26 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cntn4Q69Z26 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cntn4Q69Z26 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cntn4Q69Z26 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cntn4Q69Z26 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cntn4Q69Z26 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cntn4Q69Z26 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cntn4Q69Z26 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cntn4Q69Z26 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cntn4Q69Z26 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cntn4Q69Z26 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cntn4Q69Z26 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cntn4Q69Z26 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cntn4Q69Z26 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cntn4Q69Z26 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cntn4Q69Z26 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cntn4Q69Z26 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cntn4Q69Z26 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Cntn4Q69Z26 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cntn4Q69Z26 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cntn4Q69Z26 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cntn4Q69Z26 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cntn4Q69Z26 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cntn4Q69Z26 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cntn4Q69Z26 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cntn4Q69Z26 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cntn4Q69Z26 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cntn4Q69Z26 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cntn4Q69Z26 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cntn4Q69Z26 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cntn4Q69Z26 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Cntn4Q69Z26 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cntn4Q69Z26 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cntn4Q69Z26 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cntn4Q69Z26 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cntn4Q69Z26 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Cntn4Q69Z26 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Cntn4Q69Z26 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cntn4Q69Z26 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Cntn4Q69Z26 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cntn4Q69Z26 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cntn4Q69Z26 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cntn4Q69Z26 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Cntn4Q69Z26 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cntn4Q69Z26 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cntn4Q69Z26 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cntn4Q69Z26 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cntn4Q69Z26 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cntn4Q69Z26 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cntn4Q69Z26 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cntn4Q69Z26 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cntn4Q69Z26 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cntn4Q69Z26 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cntn4Q69Z26 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cntn4Q69Z26 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cntn4Q69Z26 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cntn4Q69Z26 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cntn4Q69Z26 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cntn4Q69Z26 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cntn4Q69Z26 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Cntn4Q69Z26 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cntn4Q69Z26 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cntn4Q69Z26 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cntn4Q69Z26 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cntn4Q69Z26 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cntn4Q69Z26 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cntn4Q69Z26 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cntn4Q69Z26 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Cntn4Q69Z26 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Cntn4Q69Z26 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Cntn4Q69Z26 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cntn4Q69Z26 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cntn4Q69Z26 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cntn4Q69Z26 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cntn4Q69Z26 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cntn4Q69Z26 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms