Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pkp4Q68FH0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pkp4Q68FH0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pkp4Q68FH0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Pkp4Q68FH0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pkp4Q68FH0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pkp4Q68FH0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pkp4Q68FH0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pkp4Q68FH0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pkp4Q68FH0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pkp4Q68FH0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pkp4Q68FH0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pkp4Q68FH0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pkp4Q68FH0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pkp4Q68FH0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pkp4Q68FH0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pkp4Q68FH0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Pkp4Q68FH0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pkp4Q68FH0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pkp4Q68FH0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pkp4Q68FH0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pkp4Q68FH0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pkp4Q68FH0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pkp4Q68FH0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pkp4Q68FH0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pkp4Q68FH0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pkp4Q68FH0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pkp4Q68FH0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pkp4Q68FH0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pkp4Q68FH0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pkp4Q68FH0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Pkp4Q68FH0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pkp4Q68FH0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pkp4Q68FH0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pkp4Q68FH0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pkp4Q68FH0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pkp4Q68FH0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pkp4Q68FH0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pkp4Q68FH0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pkp4Q68FH0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pkp4Q68FH0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pkp4Q68FH0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Pkp4Q68FH0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pkp4Q68FH0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pkp4Q68FH0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pkp4Q68FH0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pkp4Q68FH0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pkp4Q68FH0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pkp4Q68FH0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pkp4Q68FH0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pkp4Q68FH0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pkp4Q68FH0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pkp4Q68FH0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pkp4Q68FH0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pkp4Q68FH0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pkp4Q68FH0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pkp4Q68FH0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pkp4Q68FH0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pkp4Q68FH0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pkp4Q68FH0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pkp4Q68FH0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pkp4Q68FH0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pkp4Q68FH0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Pkp4Q68FH0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pkp4Q68FH0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pkp4Q68FH0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pkp4Q68FH0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pkp4Q68FH0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Pkp4Q68FH0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pkp4Q68FH0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pkp4Q68FH0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pkp4Q68FH0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pkp4Q68FH0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Pkp4Q68FH0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pkp4Q68FH0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pkp4Q68FH0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pkp4Q68FH0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pkp4Q68FH0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Pkp4Q68FH0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pkp4Q68FH0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pkp4Q68FH0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pkp4Q68FH0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pkp4Q68FH0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pkp4Q68FH0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pkp4Q68FH0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pkp4Q68FH0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pkp4Q68FH0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pkp4Q68FH0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pkp4Q68FH0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pkp4Q68FH0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Pkp4Q68FH0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pkp4Q68FH0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pkp4Q68FH0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pkp4Q68FH0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pkp4Q68FH0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pkp4Q68FH0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pkp4Q68FH0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pkp4Q68FH0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pkp4Q68FH0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Pkp4Q68FH0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms