Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtprdQ64487 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtprdQ64487 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtprdQ64487 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtprdQ64487 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtprdQ64487 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprdQ64487 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprdQ64487 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprdQ64487 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprdQ64487 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprdQ64487 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprdQ64487 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprdQ64487 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprdQ64487 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprdQ64487 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprdQ64487 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprdQ64487 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprdQ64487 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprdQ64487 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtprdQ64487 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PtprdQ64487 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtprdQ64487 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtprdQ64487 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtprdQ64487 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtprdQ64487 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtprdQ64487 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtprdQ64487 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtprdQ64487 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtprdQ64487 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtprdQ64487 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtprdQ64487 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtprdQ64487 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtprdQ64487 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtprdQ64487 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PtprdQ64487 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtprdQ64487 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtprdQ64487 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtprdQ64487 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtprdQ64487 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtprdQ64487 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtprdQ64487 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtprdQ64487 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtprdQ64487 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtprdQ64487 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtprdQ64487 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtprdQ64487 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtprdQ64487 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtprdQ64487 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtprdQ64487 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtprdQ64487 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtprdQ64487 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtprdQ64487 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PtprdQ64487 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PtprdQ64487 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PtprdQ64487 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtprdQ64487 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtprdQ64487 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtprdQ64487 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtprdQ64487 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtprdQ64487 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PtprdQ64487 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PtprdQ64487 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PtprdQ64487 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PtprdQ64487 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PtprdQ64487 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PtprdQ64487 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PtprdQ64487 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PtprdQ64487 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PtprdQ64487 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PtprdQ64487 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PtprdQ64487 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PtprdQ64487 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PtprdQ64487 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PtprdQ64487 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PtprdQ64487 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PtprdQ64487 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PtprdQ64487 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtprdQ64487 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtprdQ64487 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtprdQ64487 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtprdQ64487 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtprdQ64487 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtprdQ64487 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtprdQ64487 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtprdQ64487 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtprdQ64487 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtprdQ64487 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtprdQ64487 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtprdQ64487 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtprdQ64487 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtprdQ64487 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtprdQ64487 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtprdQ64487 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtprdQ64487 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtprdQ64487 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtprdQ64487 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtprdQ64487 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PtprdQ64487 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PtprdQ64487 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PtprdQ64487 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
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