Protein–RNA interactions for Protein: Q64444

Ca4, Carbonic anhydrase 4, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ca4Q64444 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ca4Q64444 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ca4Q64444 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ca4Q64444 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ca4Q64444 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ca4Q64444 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ca4Q64444 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ca4Q64444 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ca4Q64444 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ca4Q64444 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ca4Q64444 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ca4Q64444 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ca4Q64444 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ca4Q64444 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ca4Q64444 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ca4Q64444 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ca4Q64444 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ca4Q64444 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ca4Q64444 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ca4Q64444 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ca4Q64444 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ca4Q64444 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ca4Q64444 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ca4Q64444 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ca4Q64444 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ca4Q64444 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ca4Q64444 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ca4Q64444 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ca4Q64444 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ca4Q64444 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ca4Q64444 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ca4Q64444 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ca4Q64444 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ca4Q64444 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ca4Q64444 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ca4Q64444 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ca4Q64444 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ca4Q64444 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ca4Q64444 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Ca4Q64444 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Ca4Q64444 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ca4Q64444 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ca4Q64444 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Ca4Q64444 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ca4Q64444 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ca4Q64444 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Ca4Q64444 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ca4Q64444 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ca4Q64444 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ca4Q64444 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ca4Q64444 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Ca4Q64444 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ca4Q64444 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ca4Q64444 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ca4Q64444 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Ca4Q64444 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ca4Q64444 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ca4Q64444 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ca4Q64444 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ca4Q64444 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ca4Q64444 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ca4Q64444 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ca4Q64444 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ca4Q64444 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ca4Q64444 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ca4Q64444 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ca4Q64444 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ca4Q64444 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ca4Q64444 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ca4Q64444 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ca4Q64444 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ca4Q64444 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ca4Q64444 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ca4Q64444 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ca4Q64444 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ca4Q64444 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ca4Q64444 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ca4Q64444 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ca4Q64444 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ca4Q64444 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ca4Q64444 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ca4Q64444 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ca4Q64444 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ca4Q64444 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ca4Q64444 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ca4Q64444 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ca4Q64444 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ca4Q64444 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ca4Q64444 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ca4Q64444 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ca4Q64444 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ca4Q64444 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ca4Q64444 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ca4Q64444 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ca4Q64444 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ca4Q64444 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ca4Q64444 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Ca4Q64444 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ca4Q64444 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Ca4Q64444 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms