Protein–RNA interactions for Protein: Q64291

Krt12, Keratin, type I cytoskeletal 12, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt12Q64291 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt12Q64291 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt12Q64291 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krt12Q64291 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Krt12Q64291 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krt12Q64291 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krt12Q64291 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Krt12Q64291 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krt12Q64291 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krt12Q64291 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt12Q64291 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt12Q64291 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt12Q64291 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt12Q64291 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt12Q64291 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt12Q64291 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Krt12Q64291 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Krt12Q64291 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Krt12Q64291 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Krt12Q64291 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krt12Q64291 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krt12Q64291 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krt12Q64291 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krt12Q64291 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krt12Q64291 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krt12Q64291 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krt12Q64291 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krt12Q64291 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Krt12Q64291 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Krt12Q64291 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Krt12Q64291 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Krt12Q64291 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Krt12Q64291 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Krt12Q64291 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Krt12Q64291 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Krt12Q64291 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Krt12Q64291 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Krt12Q64291 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Krt12Q64291 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Krt12Q64291 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Krt12Q64291 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Krt12Q64291 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Krt12Q64291 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Krt12Q64291 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Krt12Q64291 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Krt12Q64291 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Krt12Q64291 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Krt12Q64291 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Krt12Q64291 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Krt12Q64291 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Krt12Q64291 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Krt12Q64291 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Krt12Q64291 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Krt12Q64291 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Krt12Q64291 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Krt12Q64291 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Krt12Q64291 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Krt12Q64291 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Krt12Q64291 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Krt12Q64291 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Krt12Q64291 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Krt12Q64291 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Krt12Q64291 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Krt12Q64291 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Krt12Q64291 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Krt12Q64291 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Krt12Q64291 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Krt12Q64291 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Krt12Q64291 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Krt12Q64291 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Krt12Q64291 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Krt12Q64291 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Krt12Q64291 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Krt12Q64291 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Krt12Q64291 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Krt12Q64291 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Krt12Q64291 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Krt12Q64291 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Krt12Q64291 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Krt12Q64291 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Krt12Q64291 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Krt12Q64291 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Krt12Q64291 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Krt12Q64291 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Krt12Q64291 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Krt12Q64291 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Krt12Q64291 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Krt12Q64291 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Krt12Q64291 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Krt12Q64291 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Krt12Q64291 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Krt12Q64291 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Krt12Q64291 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Krt12Q64291 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Krt12Q64291 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Krt12Q64291 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Krt12Q64291 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Krt12Q64291 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Krt12Q64291 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Krt12Q64291 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms