Protein–RNA interactions for Protein: Q640N4

Zfp248, Zinc finger protein 248, mousemouse

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Length 576 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp248Q640N4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Zfp248Q640N4 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp248Q640N4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp248Q640N4 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp248Q640N4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp248Q640N4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp248Q640N4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp248Q640N4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp248Q640N4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp248Q640N4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp248Q640N4 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp248Q640N4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp248Q640N4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp248Q640N4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp248Q640N4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp248Q640N4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp248Q640N4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp248Q640N4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp248Q640N4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp248Q640N4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp248Q640N4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp248Q640N4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp248Q640N4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Zfp248Q640N4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp248Q640N4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Zfp248Q640N4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp248Q640N4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp248Q640N4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Zfp248Q640N4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp248Q640N4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Zfp248Q640N4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp248Q640N4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Zfp248Q640N4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp248Q640N4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp248Q640N4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp248Q640N4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Zfp248Q640N4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Zfp248Q640N4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Zfp248Q640N4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp248Q640N4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp248Q640N4 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Zfp248Q640N4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp248Q640N4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Zfp248Q640N4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Zfp248Q640N4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp248Q640N4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp248Q640N4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp248Q640N4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp248Q640N4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp248Q640N4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp248Q640N4 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp248Q640N4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp248Q640N4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp248Q640N4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp248Q640N4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp248Q640N4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp248Q640N4 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp248Q640N4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp248Q640N4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp248Q640N4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp248Q640N4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp248Q640N4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp248Q640N4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp248Q640N4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp248Q640N4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp248Q640N4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp248Q640N4 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp248Q640N4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp248Q640N4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp248Q640N4 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp248Q640N4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp248Q640N4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp248Q640N4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp248Q640N4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp248Q640N4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp248Q640N4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp248Q640N4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
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