Protein–RNA interactions for Protein: Q63994

Cd33, Myeloid cell surface antigen CD33, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd33Q63994 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd33Q63994 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd33Q63994 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd33Q63994 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd33Q63994 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd33Q63994 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd33Q63994 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd33Q63994 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd33Q63994 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd33Q63994 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd33Q63994 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd33Q63994 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd33Q63994 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd33Q63994 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd33Q63994 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd33Q63994 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cd33Q63994 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd33Q63994 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd33Q63994 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd33Q63994 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd33Q63994 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd33Q63994 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd33Q63994 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd33Q63994 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd33Q63994 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd33Q63994 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd33Q63994 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd33Q63994 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd33Q63994 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd33Q63994 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd33Q63994 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd33Q63994 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd33Q63994 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd33Q63994 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd33Q63994 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd33Q63994 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd33Q63994 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd33Q63994 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd33Q63994 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd33Q63994 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd33Q63994 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd33Q63994 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd33Q63994 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd33Q63994 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd33Q63994 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd33Q63994 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd33Q63994 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd33Q63994 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd33Q63994 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd33Q63994 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd33Q63994 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd33Q63994 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd33Q63994 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd33Q63994 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd33Q63994 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd33Q63994 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd33Q63994 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd33Q63994 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd33Q63994 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd33Q63994 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd33Q63994 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd33Q63994 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd33Q63994 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd33Q63994 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd33Q63994 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd33Q63994 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd33Q63994 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd33Q63994 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd33Q63994 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd33Q63994 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd33Q63994 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd33Q63994 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd33Q63994 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd33Q63994 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd33Q63994 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd33Q63994 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd33Q63994 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd33Q63994 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd33Q63994 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd33Q63994 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd33Q63994 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd33Q63994 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd33Q63994 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd33Q63994 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd33Q63994 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd33Q63994 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd33Q63994 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd33Q63994 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd33Q63994 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd33Q63994 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd33Q63994 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cd33Q63994 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cd33Q63994 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cd33Q63994 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cd33Q63994 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cd33Q63994 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cd33Q63994 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cd33Q63994 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd33Q63994 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd33Q63994 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms