Protein–RNA interactions for Protein: Q62471

Lcn3, Vomeronasal secretory protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn3Q62471 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lcn3Q62471 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lcn3Q62471 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lcn3Q62471 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lcn3Q62471 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lcn3Q62471 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lcn3Q62471 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lcn3Q62471 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lcn3Q62471 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lcn3Q62471 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lcn3Q62471 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lcn3Q62471 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lcn3Q62471 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lcn3Q62471 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lcn3Q62471 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lcn3Q62471 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lcn3Q62471 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lcn3Q62471 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Lcn3Q62471 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lcn3Q62471 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lcn3Q62471 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lcn3Q62471 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lcn3Q62471 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lcn3Q62471 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lcn3Q62471 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lcn3Q62471 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lcn3Q62471 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lcn3Q62471 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lcn3Q62471 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lcn3Q62471 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lcn3Q62471 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lcn3Q62471 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lcn3Q62471 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lcn3Q62471 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lcn3Q62471 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lcn3Q62471 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lcn3Q62471 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lcn3Q62471 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lcn3Q62471 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lcn3Q62471 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lcn3Q62471 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lcn3Q62471 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lcn3Q62471 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lcn3Q62471 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lcn3Q62471 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lcn3Q62471 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lcn3Q62471 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lcn3Q62471 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lcn3Q62471 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lcn3Q62471 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Lcn3Q62471 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lcn3Q62471 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lcn3Q62471 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lcn3Q62471 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lcn3Q62471 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lcn3Q62471 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lcn3Q62471 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lcn3Q62471 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lcn3Q62471 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lcn3Q62471 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lcn3Q62471 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lcn3Q62471 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lcn3Q62471 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lcn3Q62471 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lcn3Q62471 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lcn3Q62471 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lcn3Q62471 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lcn3Q62471 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lcn3Q62471 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lcn3Q62471 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lcn3Q62471 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lcn3Q62471 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lcn3Q62471 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lcn3Q62471 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lcn3Q62471 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lcn3Q62471 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lcn3Q62471 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lcn3Q62471 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lcn3Q62471 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lcn3Q62471 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lcn3Q62471 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lcn3Q62471 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lcn3Q62471 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lcn3Q62471 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lcn3Q62471 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lcn3Q62471 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lcn3Q62471 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lcn3Q62471 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lcn3Q62471 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
Lcn3Q62471 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Lcn3Q62471 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lcn3Q62471 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lcn3Q62471 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lcn3Q62471 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lcn3Q62471 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lcn3Q62471 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lcn3Q62471 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lcn3Q62471 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lcn3Q62471 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lcn3Q62471 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms