Protein–RNA interactions for Protein: Q62447

Ccnc, Cyclin-C, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcncQ62447 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CcncQ62447 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CcncQ62447 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CcncQ62447 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CcncQ62447 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CcncQ62447 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CcncQ62447 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CcncQ62447 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CcncQ62447 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CcncQ62447 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CcncQ62447 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CcncQ62447 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CcncQ62447 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CcncQ62447 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CcncQ62447 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CcncQ62447 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CcncQ62447 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CcncQ62447 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CcncQ62447 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CcncQ62447 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CcncQ62447 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CcncQ62447 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CcncQ62447 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CcncQ62447 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CcncQ62447 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CcncQ62447 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CcncQ62447 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CcncQ62447 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CcncQ62447 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CcncQ62447 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CcncQ62447 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CcncQ62447 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CcncQ62447 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CcncQ62447 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CcncQ62447 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CcncQ62447 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CcncQ62447 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CcncQ62447 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CcncQ62447 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CcncQ62447 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CcncQ62447 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CcncQ62447 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CcncQ62447 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CcncQ62447 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CcncQ62447 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CcncQ62447 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CcncQ62447 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CcncQ62447 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CcncQ62447 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CcncQ62447 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CcncQ62447 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CcncQ62447 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CcncQ62447 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CcncQ62447 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CcncQ62447 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CcncQ62447 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CcncQ62447 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CcncQ62447 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CcncQ62447 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CcncQ62447 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CcncQ62447 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CcncQ62447 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CcncQ62447 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CcncQ62447 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CcncQ62447 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CcncQ62447 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CcncQ62447 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CcncQ62447 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CcncQ62447 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CcncQ62447 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CcncQ62447 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CcncQ62447 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CcncQ62447 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CcncQ62447 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CcncQ62447 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CcncQ62447 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CcncQ62447 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CcncQ62447 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CcncQ62447 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CcncQ62447 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CcncQ62447 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CcncQ62447 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CcncQ62447 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CcncQ62447 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CcncQ62447 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CcncQ62447 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CcncQ62447 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CcncQ62447 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CcncQ62447 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CcncQ62447 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CcncQ62447 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CcncQ62447 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CcncQ62447 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CcncQ62447 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CcncQ62447 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CcncQ62447 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CcncQ62447 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CcncQ62447 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CcncQ62447 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CcncQ62447 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms