Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hoxa13Q62424 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hoxa13Q62424 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hoxa13Q62424 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hoxa13Q62424 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hoxa13Q62424 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hoxa13Q62424 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hoxa13Q62424 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hoxa13Q62424 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Hoxa13Q62424 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Hoxa13Q62424 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hoxa13Q62424 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hoxa13Q62424 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Hoxa13Q62424 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Hoxa13Q62424 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hoxa13Q62424 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hoxa13Q62424 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hoxa13Q62424 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hoxa13Q62424 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hoxa13Q62424 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hoxa13Q62424 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hoxa13Q62424 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hoxa13Q62424 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hoxa13Q62424 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hoxa13Q62424 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hoxa13Q62424 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hoxa13Q62424 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hoxa13Q62424 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hoxa13Q62424 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hoxa13Q62424 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hoxa13Q62424 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hoxa13Q62424 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Hoxa13Q62424 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hoxa13Q62424 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hoxa13Q62424 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hoxa13Q62424 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hoxa13Q62424 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hoxa13Q62424 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hoxa13Q62424 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hoxa13Q62424 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hoxa13Q62424 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hoxa13Q62424 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hoxa13Q62424 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hoxa13Q62424 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hoxa13Q62424 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hoxa13Q62424 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hoxa13Q62424 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hoxa13Q62424 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hoxa13Q62424 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hoxa13Q62424 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hoxa13Q62424 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hoxa13Q62424 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hoxa13Q62424 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hoxa13Q62424 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hoxa13Q62424 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hoxa13Q62424 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hoxa13Q62424 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hoxa13Q62424 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hoxa13Q62424 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hoxa13Q62424 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hoxa13Q62424 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hoxa13Q62424 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hoxa13Q62424 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hoxa13Q62424 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Hoxa13Q62424 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hoxa13Q62424 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hoxa13Q62424 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hoxa13Q62424 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hoxa13Q62424 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hoxa13Q62424 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hoxa13Q62424 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hoxa13Q62424 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hoxa13Q62424 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hoxa13Q62424 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Hoxa13Q62424 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hoxa13Q62424 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hoxa13Q62424 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hoxa13Q62424 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hoxa13Q62424 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hoxa13Q62424 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hoxa13Q62424 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hoxa13Q62424 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hoxa13Q62424 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hoxa13Q62424 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hoxa13Q62424 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hoxa13Q62424 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hoxa13Q62424 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hoxa13Q62424 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hoxa13Q62424 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hoxa13Q62424 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Hoxa13Q62424 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hoxa13Q62424 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hoxa13Q62424 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hoxa13Q62424 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hoxa13Q62424 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hoxa13Q62424 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hoxa13Q62424 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hoxa13Q62424 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hoxa13Q62424 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hoxa13Q62424 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms