Protein–RNA interactions for Protein: Q62401

Ccl12, C-C motif chemokine 12, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl12Q62401 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccl12Q62401 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccl12Q62401 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccl12Q62401 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccl12Q62401 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccl12Q62401 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccl12Q62401 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccl12Q62401 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccl12Q62401 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccl12Q62401 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccl12Q62401 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccl12Q62401 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccl12Q62401 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccl12Q62401 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccl12Q62401 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccl12Q62401 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccl12Q62401 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccl12Q62401 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccl12Q62401 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccl12Q62401 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccl12Q62401 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccl12Q62401 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccl12Q62401 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccl12Q62401 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccl12Q62401 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccl12Q62401 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccl12Q62401 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccl12Q62401 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccl12Q62401 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccl12Q62401 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccl12Q62401 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccl12Q62401 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccl12Q62401 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccl12Q62401 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccl12Q62401 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccl12Q62401 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccl12Q62401 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccl12Q62401 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccl12Q62401 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccl12Q62401 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccl12Q62401 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccl12Q62401 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccl12Q62401 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccl12Q62401 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccl12Q62401 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccl12Q62401 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccl12Q62401 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccl12Q62401 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccl12Q62401 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccl12Q62401 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccl12Q62401 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccl12Q62401 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccl12Q62401 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccl12Q62401 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccl12Q62401 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccl12Q62401 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccl12Q62401 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccl12Q62401 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccl12Q62401 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccl12Q62401 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccl12Q62401 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccl12Q62401 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccl12Q62401 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ccl12Q62401 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccl12Q62401 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccl12Q62401 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccl12Q62401 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccl12Q62401 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccl12Q62401 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccl12Q62401 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccl12Q62401 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccl12Q62401 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccl12Q62401 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccl12Q62401 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccl12Q62401 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccl12Q62401 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccl12Q62401 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccl12Q62401 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccl12Q62401 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccl12Q62401 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccl12Q62401 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccl12Q62401 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccl12Q62401 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccl12Q62401 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccl12Q62401 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccl12Q62401 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccl12Q62401 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccl12Q62401 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccl12Q62401 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccl12Q62401 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccl12Q62401 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccl12Q62401 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccl12Q62401 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccl12Q62401 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccl12Q62401 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccl12Q62401 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccl12Q62401 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccl12Q62401 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccl12Q62401 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccl12Q62401 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms