Protein–RNA interactions for Protein: Q62167

Ddx3x, ATP-dependent RNA helicase DDX3X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx3xQ62167 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ddx3xQ62167 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ddx3xQ62167 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ddx3xQ62167 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ddx3xQ62167 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ddx3xQ62167 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ddx3xQ62167 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ddx3xQ62167 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ddx3xQ62167 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ddx3xQ62167 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ddx3xQ62167 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ddx3xQ62167 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ddx3xQ62167 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ddx3xQ62167 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ddx3xQ62167 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ddx3xQ62167 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ddx3xQ62167 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ddx3xQ62167 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ddx3xQ62167 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ddx3xQ62167 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ddx3xQ62167 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ddx3xQ62167 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ddx3xQ62167 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ddx3xQ62167 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ddx3xQ62167 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ddx3xQ62167 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ddx3xQ62167 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ddx3xQ62167 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ddx3xQ62167 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ddx3xQ62167 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ddx3xQ62167 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ddx3xQ62167 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ddx3xQ62167 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ddx3xQ62167 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ddx3xQ62167 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ddx3xQ62167 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ddx3xQ62167 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ddx3xQ62167 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ddx3xQ62167 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ddx3xQ62167 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ddx3xQ62167 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ddx3xQ62167 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ddx3xQ62167 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ddx3xQ62167 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ddx3xQ62167 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ddx3xQ62167 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ddx3xQ62167 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ddx3xQ62167 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ddx3xQ62167 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ddx3xQ62167 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ddx3xQ62167 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ddx3xQ62167 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ddx3xQ62167 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ddx3xQ62167 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ddx3xQ62167 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ddx3xQ62167 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ddx3xQ62167 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ddx3xQ62167 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ddx3xQ62167 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ddx3xQ62167 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ddx3xQ62167 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ddx3xQ62167 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ddx3xQ62167 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ddx3xQ62167 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ddx3xQ62167 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ddx3xQ62167 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ddx3xQ62167 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ddx3xQ62167 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ddx3xQ62167 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ddx3xQ62167 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ddx3xQ62167 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ddx3xQ62167 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ddx3xQ62167 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ddx3xQ62167 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ddx3xQ62167 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ddx3xQ62167 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ddx3xQ62167 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ddx3xQ62167 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ddx3xQ62167 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ddx3xQ62167 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ddx3xQ62167 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ddx3xQ62167 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ddx3xQ62167 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ddx3xQ62167 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ddx3xQ62167 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ddx3xQ62167 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ddx3xQ62167 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ddx3xQ62167 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ddx3xQ62167 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ddx3xQ62167 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ddx3xQ62167 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ddx3xQ62167 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ddx3xQ62167 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ddx3xQ62167 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ddx3xQ62167 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ddx3xQ62167 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ddx3xQ62167 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ddx3xQ62167 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ddx3xQ62167 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ddx3xQ62167 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms