Protein–RNA interactions for Protein: Q62100

Prm3, Protamine-3, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prm3Q62100 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Prm3Q62100 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prm3Q62100 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prm3Q62100 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prm3Q62100 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prm3Q62100 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prm3Q62100 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prm3Q62100 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prm3Q62100 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prm3Q62100 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prm3Q62100 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prm3Q62100 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prm3Q62100 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prm3Q62100 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prm3Q62100 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prm3Q62100 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prm3Q62100 Gm14201-201ENSMUST00000117627 289 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Prm3Q62100 Atp6v1c2-207ENSMUST00000156727 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prm3Q62100 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prm3Q62100 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prm3Q62100 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prm3Q62100 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prm3Q62100 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prm3Q62100 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prm3Q62100 Gm13780-201ENSMUST00000150482 1187 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prm3Q62100 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prm3Q62100 Gm36943-201ENSMUST00000194422 282 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Prm3Q62100 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prm3Q62100 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prm3Q62100 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prm3Q62100 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prm3Q62100 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prm3Q62100 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prm3Q62100 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prm3Q62100 Nr6a1os-201ENSMUST00000129089 645 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prm3Q62100 Gm27227-201ENSMUST00000183413 633 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prm3Q62100 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prm3Q62100 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prm3Q62100 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prm3Q62100 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prm3Q62100 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prm3Q62100 Gm38188-201ENSMUST00000192879 856 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Prm3Q62100 D530018E20Rik-201ENSMUST00000205107 958 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Prm3Q62100 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prm3Q62100 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prm3Q62100 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prm3Q62100 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prm3Q62100 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prm3Q62100 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prm3Q62100 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Prm3Q62100 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prm3Q62100 Gm37293-201ENSMUST00000191658 295 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Prm3Q62100 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prm3Q62100 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prm3Q62100 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prm3Q62100 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prm3Q62100 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prm3Q62100 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prm3Q62100 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prm3Q62100 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prm3Q62100 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prm3Q62100 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prm3Q62100 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prm3Q62100 Gm11077-201ENSMUST00000111844 84 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prm3Q62100 Gm28975-201ENSMUST00000186412 686 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Prm3Q62100 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prm3Q62100 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prm3Q62100 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prm3Q62100 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prm3Q62100 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prm3Q62100 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prm3Q62100 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prm3Q62100 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prm3Q62100 Gm15074-201ENSMUST00000117603 936 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Prm3Q62100 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prm3Q62100 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prm3Q62100 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prm3Q62100 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prm3Q62100 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prm3Q62100 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prm3Q62100 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prm3Q62100 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prm3Q62100 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prm3Q62100 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prm3Q62100 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prm3Q62100 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prm3Q62100 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prm3Q62100 Letm2-206ENSMUST00000210234 837 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prm3Q62100 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prm3Q62100 4933400A11Rik-201ENSMUST00000068874 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prm3Q62100 4933400A11Rik-202ENSMUST00000068894 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prm3Q62100 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prm3Q62100 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prm3Q62100 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prm3Q62100 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prm3Q62100 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prm3Q62100 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prm3Q62100 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prm3Q62100 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prm3Q62100 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
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