Protein–RNA interactions for Protein: Q62066

Phox2a, Paired mesoderm homeobox protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2aQ62066 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Phox2aQ62066 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Phox2aQ62066 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Phox2aQ62066 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Phox2aQ62066 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Phox2aQ62066 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Phox2aQ62066 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Phox2aQ62066 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Phox2aQ62066 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Phox2aQ62066 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Phox2aQ62066 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Phox2aQ62066 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Phox2aQ62066 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Phox2aQ62066 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Phox2aQ62066 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Phox2aQ62066 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Phox2aQ62066 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Phox2aQ62066 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Phox2aQ62066 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Phox2aQ62066 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Phox2aQ62066 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Phox2aQ62066 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Phox2aQ62066 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Phox2aQ62066 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Phox2aQ62066 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Phox2aQ62066 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Phox2aQ62066 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Phox2aQ62066 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Phox2aQ62066 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Phox2aQ62066 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Phox2aQ62066 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Phox2aQ62066 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Phox2aQ62066 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Phox2aQ62066 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Phox2aQ62066 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Phox2aQ62066 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Phox2aQ62066 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Phox2aQ62066 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Phox2aQ62066 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Phox2aQ62066 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phox2aQ62066 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phox2aQ62066 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phox2aQ62066 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Phox2aQ62066 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phox2aQ62066 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phox2aQ62066 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phox2aQ62066 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phox2aQ62066 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phox2aQ62066 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phox2aQ62066 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phox2aQ62066 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phox2aQ62066 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phox2aQ62066 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phox2aQ62066 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phox2aQ62066 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phox2aQ62066 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phox2aQ62066 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phox2aQ62066 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phox2aQ62066 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phox2aQ62066 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phox2aQ62066 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phox2aQ62066 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phox2aQ62066 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phox2aQ62066 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phox2aQ62066 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Phox2aQ62066 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Phox2aQ62066 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Phox2aQ62066 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Phox2aQ62066 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Phox2aQ62066 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Phox2aQ62066 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Phox2aQ62066 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Phox2aQ62066 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Phox2aQ62066 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Phox2aQ62066 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phox2aQ62066 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phox2aQ62066 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phox2aQ62066 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phox2aQ62066 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phox2aQ62066 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phox2aQ62066 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Phox2aQ62066 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phox2aQ62066 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phox2aQ62066 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phox2aQ62066 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Phox2aQ62066 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Phox2aQ62066 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Phox2aQ62066 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Phox2aQ62066 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Phox2aQ62066 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Phox2aQ62066 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Phox2aQ62066 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Phox2aQ62066 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Phox2aQ62066 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Phox2aQ62066 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Phox2aQ62066 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Phox2aQ62066 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Phox2aQ62066 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Phox2aQ62066 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Phox2aQ62066 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms