Protein–RNA interactions for Protein: Q61999

Odf1, Outer dense fiber protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf1Q61999 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Odf1Q61999 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Odf1Q61999 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Odf1Q61999 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Odf1Q61999 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Odf1Q61999 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Odf1Q61999 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Odf1Q61999 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Odf1Q61999 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Odf1Q61999 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Odf1Q61999 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Odf1Q61999 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Odf1Q61999 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Odf1Q61999 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Odf1Q61999 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Odf1Q61999 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Odf1Q61999 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Odf1Q61999 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Odf1Q61999 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Odf1Q61999 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Odf1Q61999 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Odf1Q61999 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Odf1Q61999 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Odf1Q61999 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Odf1Q61999 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Odf1Q61999 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Odf1Q61999 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Odf1Q61999 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Odf1Q61999 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Odf1Q61999 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Odf1Q61999 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Odf1Q61999 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Odf1Q61999 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Odf1Q61999 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Odf1Q61999 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Odf1Q61999 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Odf1Q61999 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Odf1Q61999 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Odf1Q61999 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Odf1Q61999 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Odf1Q61999 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Odf1Q61999 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Odf1Q61999 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Odf1Q61999 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Odf1Q61999 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Odf1Q61999 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Odf1Q61999 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Odf1Q61999 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Odf1Q61999 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Odf1Q61999 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Odf1Q61999 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Odf1Q61999 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Odf1Q61999 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Odf1Q61999 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Odf1Q61999 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Odf1Q61999 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Odf1Q61999 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Odf1Q61999 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Odf1Q61999 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Odf1Q61999 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Odf1Q61999 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Odf1Q61999 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Odf1Q61999 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Odf1Q61999 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Odf1Q61999 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Odf1Q61999 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Odf1Q61999 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Odf1Q61999 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Odf1Q61999 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Odf1Q61999 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Odf1Q61999 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Odf1Q61999 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Odf1Q61999 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Odf1Q61999 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Odf1Q61999 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Odf1Q61999 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Odf1Q61999 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Odf1Q61999 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Odf1Q61999 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Odf1Q61999 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Odf1Q61999 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Odf1Q61999 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Odf1Q61999 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Odf1Q61999 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Odf1Q61999 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Odf1Q61999 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Odf1Q61999 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Odf1Q61999 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Odf1Q61999 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Odf1Q61999 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Odf1Q61999 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Odf1Q61999 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Odf1Q61999 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Odf1Q61999 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Odf1Q61999 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Odf1Q61999 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Odf1Q61999 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Odf1Q61999 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Odf1Q61999 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Odf1Q61999 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1282.7 ms