Protein–RNA interactions for Protein: Q61644

Pacsin1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin1Q61644 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pacsin1Q61644 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pacsin1Q61644 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pacsin1Q61644 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pacsin1Q61644 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pacsin1Q61644 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pacsin1Q61644 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pacsin1Q61644 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pacsin1Q61644 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pacsin1Q61644 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pacsin1Q61644 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pacsin1Q61644 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pacsin1Q61644 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pacsin1Q61644 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pacsin1Q61644 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pacsin1Q61644 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pacsin1Q61644 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pacsin1Q61644 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pacsin1Q61644 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pacsin1Q61644 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pacsin1Q61644 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pacsin1Q61644 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pacsin1Q61644 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pacsin1Q61644 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pacsin1Q61644 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pacsin1Q61644 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pacsin1Q61644 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pacsin1Q61644 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pacsin1Q61644 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pacsin1Q61644 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pacsin1Q61644 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pacsin1Q61644 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pacsin1Q61644 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pacsin1Q61644 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pacsin1Q61644 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Pacsin1Q61644 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pacsin1Q61644 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pacsin1Q61644 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pacsin1Q61644 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pacsin1Q61644 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pacsin1Q61644 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Pacsin1Q61644 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pacsin1Q61644 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pacsin1Q61644 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pacsin1Q61644 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pacsin1Q61644 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pacsin1Q61644 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pacsin1Q61644 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pacsin1Q61644 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pacsin1Q61644 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pacsin1Q61644 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Pacsin1Q61644 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pacsin1Q61644 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pacsin1Q61644 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pacsin1Q61644 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pacsin1Q61644 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pacsin1Q61644 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pacsin1Q61644 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pacsin1Q61644 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Pacsin1Q61644 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pacsin1Q61644 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pacsin1Q61644 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pacsin1Q61644 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pacsin1Q61644 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pacsin1Q61644 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pacsin1Q61644 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pacsin1Q61644 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pacsin1Q61644 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pacsin1Q61644 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pacsin1Q61644 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pacsin1Q61644 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pacsin1Q61644 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pacsin1Q61644 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pacsin1Q61644 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pacsin1Q61644 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pacsin1Q61644 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pacsin1Q61644 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pacsin1Q61644 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pacsin1Q61644 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pacsin1Q61644 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pacsin1Q61644 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pacsin1Q61644 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Pacsin1Q61644 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pacsin1Q61644 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pacsin1Q61644 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pacsin1Q61644 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pacsin1Q61644 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Pacsin1Q61644 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Pacsin1Q61644 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pacsin1Q61644 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pacsin1Q61644 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pacsin1Q61644 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Pacsin1Q61644 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pacsin1Q61644 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pacsin1Q61644 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pacsin1Q61644 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pacsin1Q61644 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pacsin1Q61644 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pacsin1Q61644 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pacsin1Q61644 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms