Protein–RNA interactions for Protein: Q61490

Alcam, CD166 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlcamQ61490 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AlcamQ61490 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AlcamQ61490 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AlcamQ61490 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AlcamQ61490 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AlcamQ61490 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AlcamQ61490 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
AlcamQ61490 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AlcamQ61490 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AlcamQ61490 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
AlcamQ61490 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
AlcamQ61490 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AlcamQ61490 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AlcamQ61490 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AlcamQ61490 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AlcamQ61490 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AlcamQ61490 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AlcamQ61490 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AlcamQ61490 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AlcamQ61490 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AlcamQ61490 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
AlcamQ61490 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
AlcamQ61490 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
AlcamQ61490 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AlcamQ61490 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AlcamQ61490 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AlcamQ61490 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AlcamQ61490 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AlcamQ61490 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AlcamQ61490 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
AlcamQ61490 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AlcamQ61490 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AlcamQ61490 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AlcamQ61490 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AlcamQ61490 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AlcamQ61490 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AlcamQ61490 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AlcamQ61490 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
AlcamQ61490 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AlcamQ61490 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AlcamQ61490 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AlcamQ61490 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AlcamQ61490 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
AlcamQ61490 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AlcamQ61490 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AlcamQ61490 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AlcamQ61490 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AlcamQ61490 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AlcamQ61490 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AlcamQ61490 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
AlcamQ61490 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AlcamQ61490 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AlcamQ61490 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AlcamQ61490 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AlcamQ61490 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AlcamQ61490 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AlcamQ61490 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AlcamQ61490 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AlcamQ61490 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AlcamQ61490 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AlcamQ61490 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AlcamQ61490 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AlcamQ61490 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AlcamQ61490 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AlcamQ61490 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AlcamQ61490 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AlcamQ61490 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AlcamQ61490 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
AlcamQ61490 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AlcamQ61490 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AlcamQ61490 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AlcamQ61490 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AlcamQ61490 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AlcamQ61490 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AlcamQ61490 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AlcamQ61490 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
AlcamQ61490 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AlcamQ61490 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AlcamQ61490 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AlcamQ61490 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
AlcamQ61490 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AlcamQ61490 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AlcamQ61490 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AlcamQ61490 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AlcamQ61490 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AlcamQ61490 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AlcamQ61490 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AlcamQ61490 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AlcamQ61490 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AlcamQ61490 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AlcamQ61490 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AlcamQ61490 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AlcamQ61490 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AlcamQ61490 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AlcamQ61490 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AlcamQ61490 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AlcamQ61490 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AlcamQ61490 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
AlcamQ61490 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
AlcamQ61490 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms