Protein–RNA interactions for Protein: Q61457

Ccne1, G1/S-specific cyclin-E1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne1Q61457 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccne1Q61457 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccne1Q61457 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccne1Q61457 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccne1Q61457 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccne1Q61457 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccne1Q61457 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccne1Q61457 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccne1Q61457 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccne1Q61457 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccne1Q61457 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccne1Q61457 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccne1Q61457 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccne1Q61457 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccne1Q61457 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccne1Q61457 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccne1Q61457 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccne1Q61457 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccne1Q61457 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccne1Q61457 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccne1Q61457 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccne1Q61457 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccne1Q61457 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccne1Q61457 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccne1Q61457 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ccne1Q61457 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ccne1Q61457 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ccne1Q61457 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ccne1Q61457 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ccne1Q61457 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ccne1Q61457 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ccne1Q61457 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ccne1Q61457 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ccne1Q61457 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ccne1Q61457 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccne1Q61457 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccne1Q61457 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccne1Q61457 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccne1Q61457 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccne1Q61457 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccne1Q61457 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccne1Q61457 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccne1Q61457 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccne1Q61457 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccne1Q61457 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccne1Q61457 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccne1Q61457 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccne1Q61457 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccne1Q61457 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccne1Q61457 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccne1Q61457 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccne1Q61457 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccne1Q61457 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccne1Q61457 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccne1Q61457 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccne1Q61457 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccne1Q61457 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccne1Q61457 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccne1Q61457 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccne1Q61457 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccne1Q61457 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccne1Q61457 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccne1Q61457 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccne1Q61457 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccne1Q61457 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccne1Q61457 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccne1Q61457 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccne1Q61457 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccne1Q61457 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccne1Q61457 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccne1Q61457 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccne1Q61457 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccne1Q61457 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccne1Q61457 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccne1Q61457 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccne1Q61457 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccne1Q61457 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccne1Q61457 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccne1Q61457 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccne1Q61457 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccne1Q61457 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccne1Q61457 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccne1Q61457 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccne1Q61457 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccne1Q61457 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccne1Q61457 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccne1Q61457 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccne1Q61457 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccne1Q61457 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccne1Q61457 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccne1Q61457 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccne1Q61457 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccne1Q61457 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccne1Q61457 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccne1Q61457 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccne1Q61457 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccne1Q61457 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccne1Q61457 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
Ccne1Q61457 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccne1Q61457 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms