Protein–RNA interactions for Protein: Q61282

Acan, Aggrecan core protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AcanQ61282 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
AcanQ61282 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AcanQ61282 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AcanQ61282 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AcanQ61282 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AcanQ61282 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
AcanQ61282 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AcanQ61282 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AcanQ61282 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
AcanQ61282 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
AcanQ61282 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
AcanQ61282 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
AcanQ61282 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
AcanQ61282 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
AcanQ61282 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
AcanQ61282 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
AcanQ61282 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
AcanQ61282 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
AcanQ61282 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
AcanQ61282 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
AcanQ61282 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AcanQ61282 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AcanQ61282 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AcanQ61282 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AcanQ61282 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AcanQ61282 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AcanQ61282 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AcanQ61282 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
AcanQ61282 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AcanQ61282 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AcanQ61282 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AcanQ61282 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AcanQ61282 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AcanQ61282 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AcanQ61282 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AcanQ61282 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AcanQ61282 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AcanQ61282 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
AcanQ61282 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
AcanQ61282 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AcanQ61282 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
AcanQ61282 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
AcanQ61282 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
AcanQ61282 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
AcanQ61282 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
AcanQ61282 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
AcanQ61282 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
AcanQ61282 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
AcanQ61282 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
AcanQ61282 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AcanQ61282 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AcanQ61282 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
AcanQ61282 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
AcanQ61282 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
AcanQ61282 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AcanQ61282 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AcanQ61282 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
AcanQ61282 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
AcanQ61282 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AcanQ61282 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
AcanQ61282 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
AcanQ61282 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AcanQ61282 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AcanQ61282 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AcanQ61282 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
AcanQ61282 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AcanQ61282 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AcanQ61282 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AcanQ61282 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AcanQ61282 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AcanQ61282 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AcanQ61282 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AcanQ61282 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AcanQ61282 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
AcanQ61282 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AcanQ61282 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AcanQ61282 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AcanQ61282 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
AcanQ61282 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
AcanQ61282 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
AcanQ61282 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
AcanQ61282 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
AcanQ61282 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
AcanQ61282 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AcanQ61282 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AcanQ61282 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
AcanQ61282 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AcanQ61282 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AcanQ61282 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17■□□□□ 0.31
AcanQ61282 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AcanQ61282 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AcanQ61282 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AcanQ61282 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AcanQ61282 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AcanQ61282 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AcanQ61282 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AcanQ61282 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AcanQ61282 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AcanQ61282 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
AcanQ61282 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms