Protein–RNA interactions for Protein: Q61233

Lcp1, Plastin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcp1Q61233 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lcp1Q61233 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lcp1Q61233 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lcp1Q61233 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lcp1Q61233 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lcp1Q61233 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lcp1Q61233 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lcp1Q61233 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lcp1Q61233 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lcp1Q61233 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lcp1Q61233 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lcp1Q61233 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lcp1Q61233 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lcp1Q61233 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lcp1Q61233 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lcp1Q61233 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lcp1Q61233 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lcp1Q61233 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lcp1Q61233 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lcp1Q61233 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lcp1Q61233 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Lcp1Q61233 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lcp1Q61233 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Lcp1Q61233 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lcp1Q61233 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lcp1Q61233 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lcp1Q61233 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lcp1Q61233 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lcp1Q61233 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lcp1Q61233 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lcp1Q61233 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lcp1Q61233 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lcp1Q61233 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lcp1Q61233 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lcp1Q61233 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lcp1Q61233 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lcp1Q61233 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lcp1Q61233 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lcp1Q61233 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lcp1Q61233 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lcp1Q61233 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lcp1Q61233 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lcp1Q61233 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lcp1Q61233 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lcp1Q61233 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lcp1Q61233 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lcp1Q61233 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lcp1Q61233 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lcp1Q61233 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lcp1Q61233 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lcp1Q61233 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lcp1Q61233 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lcp1Q61233 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lcp1Q61233 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lcp1Q61233 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lcp1Q61233 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lcp1Q61233 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Lcp1Q61233 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lcp1Q61233 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lcp1Q61233 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lcp1Q61233 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lcp1Q61233 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lcp1Q61233 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lcp1Q61233 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lcp1Q61233 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Lcp1Q61233 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lcp1Q61233 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lcp1Q61233 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lcp1Q61233 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lcp1Q61233 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lcp1Q61233 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lcp1Q61233 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lcp1Q61233 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lcp1Q61233 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lcp1Q61233 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lcp1Q61233 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lcp1Q61233 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lcp1Q61233 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lcp1Q61233 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lcp1Q61233 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lcp1Q61233 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lcp1Q61233 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lcp1Q61233 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lcp1Q61233 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lcp1Q61233 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lcp1Q61233 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lcp1Q61233 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Lcp1Q61233 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lcp1Q61233 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lcp1Q61233 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Lcp1Q61233 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lcp1Q61233 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Lcp1Q61233 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lcp1Q61233 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lcp1Q61233 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lcp1Q61233 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Lcp1Q61233 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lcp1Q61233 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lcp1Q61233 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lcp1Q61233 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms