Protein–RNA interactions for Protein: Q61068

Usp17la, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein A, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17laQ61068 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp17laQ61068 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp17laQ61068 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp17laQ61068 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp17laQ61068 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp17laQ61068 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Usp17laQ61068 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp17laQ61068 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp17laQ61068 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp17laQ61068 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp17laQ61068 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp17laQ61068 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp17laQ61068 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp17laQ61068 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp17laQ61068 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp17laQ61068 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp17laQ61068 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp17laQ61068 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp17laQ61068 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp17laQ61068 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp17laQ61068 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp17laQ61068 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp17laQ61068 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp17laQ61068 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp17laQ61068 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp17laQ61068 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp17laQ61068 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp17laQ61068 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp17laQ61068 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp17laQ61068 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp17laQ61068 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp17laQ61068 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp17laQ61068 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp17laQ61068 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp17laQ61068 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp17laQ61068 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp17laQ61068 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp17laQ61068 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp17laQ61068 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp17laQ61068 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp17laQ61068 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp17laQ61068 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp17laQ61068 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp17laQ61068 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp17laQ61068 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp17laQ61068 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp17laQ61068 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp17laQ61068 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp17laQ61068 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp17laQ61068 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp17laQ61068 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp17laQ61068 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp17laQ61068 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp17laQ61068 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp17laQ61068 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp17laQ61068 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp17laQ61068 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp17laQ61068 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp17laQ61068 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp17laQ61068 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp17laQ61068 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp17laQ61068 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp17laQ61068 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp17laQ61068 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp17laQ61068 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp17laQ61068 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp17laQ61068 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp17laQ61068 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp17laQ61068 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp17laQ61068 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp17laQ61068 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp17laQ61068 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp17laQ61068 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp17laQ61068 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp17laQ61068 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp17laQ61068 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp17laQ61068 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp17laQ61068 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp17laQ61068 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp17laQ61068 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp17laQ61068 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp17laQ61068 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp17laQ61068 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp17laQ61068 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp17laQ61068 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp17laQ61068 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp17laQ61068 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp17laQ61068 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp17laQ61068 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp17laQ61068 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp17laQ61068 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp17laQ61068 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp17laQ61068 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp17laQ61068 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp17laQ61068 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp17laQ61068 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp17laQ61068 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp17laQ61068 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp17laQ61068 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp17laQ61068 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms