Protein–RNA interactions for Protein: Q60960

Kpna1, Importin subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna1Q60960 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kpna1Q60960 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kpna1Q60960 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kpna1Q60960 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kpna1Q60960 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kpna1Q60960 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kpna1Q60960 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kpna1Q60960 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kpna1Q60960 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kpna1Q60960 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kpna1Q60960 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kpna1Q60960 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kpna1Q60960 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kpna1Q60960 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kpna1Q60960 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Kpna1Q60960 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kpna1Q60960 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kpna1Q60960 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Kpna1Q60960 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kpna1Q60960 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kpna1Q60960 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kpna1Q60960 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kpna1Q60960 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kpna1Q60960 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kpna1Q60960 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kpna1Q60960 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kpna1Q60960 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kpna1Q60960 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kpna1Q60960 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kpna1Q60960 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kpna1Q60960 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kpna1Q60960 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kpna1Q60960 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Kpna1Q60960 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kpna1Q60960 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kpna1Q60960 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kpna1Q60960 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Kpna1Q60960 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kpna1Q60960 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kpna1Q60960 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kpna1Q60960 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kpna1Q60960 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kpna1Q60960 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Kpna1Q60960 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kpna1Q60960 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kpna1Q60960 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kpna1Q60960 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kpna1Q60960 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kpna1Q60960 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kpna1Q60960 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kpna1Q60960 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kpna1Q60960 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kpna1Q60960 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kpna1Q60960 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kpna1Q60960 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kpna1Q60960 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kpna1Q60960 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kpna1Q60960 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kpna1Q60960 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kpna1Q60960 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kpna1Q60960 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kpna1Q60960 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kpna1Q60960 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kpna1Q60960 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Kpna1Q60960 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kpna1Q60960 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kpna1Q60960 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kpna1Q60960 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kpna1Q60960 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kpna1Q60960 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Kpna1Q60960 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kpna1Q60960 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kpna1Q60960 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kpna1Q60960 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kpna1Q60960 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kpna1Q60960 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kpna1Q60960 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kpna1Q60960 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kpna1Q60960 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kpna1Q60960 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kpna1Q60960 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kpna1Q60960 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kpna1Q60960 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kpna1Q60960 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kpna1Q60960 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kpna1Q60960 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kpna1Q60960 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kpna1Q60960 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kpna1Q60960 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kpna1Q60960 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kpna1Q60960 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kpna1Q60960 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kpna1Q60960 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kpna1Q60960 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kpna1Q60960 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kpna1Q60960 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kpna1Q60960 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kpna1Q60960 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kpna1Q60960 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kpna1Q60960 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms