Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CttnQ60598 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CttnQ60598 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CttnQ60598 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CttnQ60598 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CttnQ60598 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CttnQ60598 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CttnQ60598 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CttnQ60598 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CttnQ60598 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CttnQ60598 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CttnQ60598 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CttnQ60598 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CttnQ60598 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CttnQ60598 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CttnQ60598 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CttnQ60598 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CttnQ60598 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CttnQ60598 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CttnQ60598 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CttnQ60598 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CttnQ60598 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CttnQ60598 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CttnQ60598 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CttnQ60598 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CttnQ60598 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CttnQ60598 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CttnQ60598 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CttnQ60598 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CttnQ60598 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CttnQ60598 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CttnQ60598 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CttnQ60598 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CttnQ60598 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CttnQ60598 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CttnQ60598 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CttnQ60598 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CttnQ60598 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CttnQ60598 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CttnQ60598 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CttnQ60598 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CttnQ60598 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CttnQ60598 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CttnQ60598 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CttnQ60598 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CttnQ60598 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CttnQ60598 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CttnQ60598 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CttnQ60598 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CttnQ60598 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CttnQ60598 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CttnQ60598 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CttnQ60598 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CttnQ60598 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CttnQ60598 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CttnQ60598 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CttnQ60598 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CttnQ60598 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CttnQ60598 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CttnQ60598 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CttnQ60598 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CttnQ60598 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CttnQ60598 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CttnQ60598 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CttnQ60598 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CttnQ60598 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CttnQ60598 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CttnQ60598 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CttnQ60598 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CttnQ60598 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CttnQ60598 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CttnQ60598 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CttnQ60598 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CttnQ60598 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CttnQ60598 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CttnQ60598 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CttnQ60598 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CttnQ60598 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CttnQ60598 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CttnQ60598 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CttnQ60598 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CttnQ60598 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CttnQ60598 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CttnQ60598 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CttnQ60598 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CttnQ60598 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CttnQ60598 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CttnQ60598 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CttnQ60598 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CttnQ60598 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CttnQ60598 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CttnQ60598 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CttnQ60598 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CttnQ60598 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CttnQ60598 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CttnQ60598 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CttnQ60598 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CttnQ60598 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CttnQ60598 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CttnQ60598 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms