Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXJ3

Brip1, Fanconi anemia group J protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brip1Q5SXJ3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Brip1Q5SXJ3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Brip1Q5SXJ3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Brip1Q5SXJ3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Brip1Q5SXJ3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Brip1Q5SXJ3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Brip1Q5SXJ3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Brip1Q5SXJ3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Brip1Q5SXJ3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Brip1Q5SXJ3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Brip1Q5SXJ3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Brip1Q5SXJ3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Brip1Q5SXJ3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Brip1Q5SXJ3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Brip1Q5SXJ3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Brip1Q5SXJ3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Brip1Q5SXJ3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Brip1Q5SXJ3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Brip1Q5SXJ3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Brip1Q5SXJ3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Brip1Q5SXJ3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Brip1Q5SXJ3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Brip1Q5SXJ3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Brip1Q5SXJ3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Brip1Q5SXJ3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Brip1Q5SXJ3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Brip1Q5SXJ3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Brip1Q5SXJ3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Brip1Q5SXJ3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Brip1Q5SXJ3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Brip1Q5SXJ3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Brip1Q5SXJ3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Brip1Q5SXJ3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Brip1Q5SXJ3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Brip1Q5SXJ3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Brip1Q5SXJ3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Brip1Q5SXJ3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Brip1Q5SXJ3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Brip1Q5SXJ3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Brip1Q5SXJ3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Brip1Q5SXJ3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Brip1Q5SXJ3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Brip1Q5SXJ3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Brip1Q5SXJ3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Brip1Q5SXJ3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Brip1Q5SXJ3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Brip1Q5SXJ3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Brip1Q5SXJ3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Brip1Q5SXJ3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Brip1Q5SXJ3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Brip1Q5SXJ3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Brip1Q5SXJ3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Brip1Q5SXJ3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Brip1Q5SXJ3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Brip1Q5SXJ3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Brip1Q5SXJ3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Brip1Q5SXJ3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Brip1Q5SXJ3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Brip1Q5SXJ3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Brip1Q5SXJ3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Brip1Q5SXJ3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Brip1Q5SXJ3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Brip1Q5SXJ3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Brip1Q5SXJ3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Brip1Q5SXJ3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Brip1Q5SXJ3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Brip1Q5SXJ3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Brip1Q5SXJ3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Brip1Q5SXJ3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Brip1Q5SXJ3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Brip1Q5SXJ3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Brip1Q5SXJ3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Brip1Q5SXJ3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Brip1Q5SXJ3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Brip1Q5SXJ3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Brip1Q5SXJ3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Brip1Q5SXJ3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Brip1Q5SXJ3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Brip1Q5SXJ3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Brip1Q5SXJ3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Brip1Q5SXJ3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Brip1Q5SXJ3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Brip1Q5SXJ3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Brip1Q5SXJ3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Brip1Q5SXJ3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Brip1Q5SXJ3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Brip1Q5SXJ3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Brip1Q5SXJ3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Brip1Q5SXJ3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Brip1Q5SXJ3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Brip1Q5SXJ3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Brip1Q5SXJ3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Brip1Q5SXJ3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Brip1Q5SXJ3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Brip1Q5SXJ3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Brip1Q5SXJ3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Brip1Q5SXJ3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Brip1Q5SXJ3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Brip1Q5SXJ3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Brip1Q5SXJ3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms