Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Tsr1Q5SWD9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tsr1Q5SWD9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tsr1Q5SWD9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tsr1Q5SWD9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tsr1Q5SWD9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tsr1Q5SWD9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tsr1Q5SWD9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tsr1Q5SWD9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tsr1Q5SWD9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tsr1Q5SWD9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tsr1Q5SWD9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tsr1Q5SWD9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tsr1Q5SWD9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tsr1Q5SWD9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tsr1Q5SWD9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tsr1Q5SWD9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tsr1Q5SWD9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tsr1Q5SWD9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tsr1Q5SWD9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tsr1Q5SWD9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tsr1Q5SWD9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Tsr1Q5SWD9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tsr1Q5SWD9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tsr1Q5SWD9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Tsr1Q5SWD9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tsr1Q5SWD9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tsr1Q5SWD9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tsr1Q5SWD9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tsr1Q5SWD9 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Tsr1Q5SWD9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tsr1Q5SWD9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tsr1Q5SWD9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tsr1Q5SWD9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tsr1Q5SWD9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Tsr1Q5SWD9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tsr1Q5SWD9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tsr1Q5SWD9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tsr1Q5SWD9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tsr1Q5SWD9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tsr1Q5SWD9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tsr1Q5SWD9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tsr1Q5SWD9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tsr1Q5SWD9 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tsr1Q5SWD9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tsr1Q5SWD9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tsr1Q5SWD9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tsr1Q5SWD9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tsr1Q5SWD9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tsr1Q5SWD9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tsr1Q5SWD9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Tsr1Q5SWD9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Tsr1Q5SWD9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tsr1Q5SWD9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tsr1Q5SWD9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tsr1Q5SWD9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tsr1Q5SWD9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tsr1Q5SWD9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tsr1Q5SWD9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tsr1Q5SWD9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tsr1Q5SWD9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tsr1Q5SWD9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Tsr1Q5SWD9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tsr1Q5SWD9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tsr1Q5SWD9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tsr1Q5SWD9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tsr1Q5SWD9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tsr1Q5SWD9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tsr1Q5SWD9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tsr1Q5SWD9 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tsr1Q5SWD9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tsr1Q5SWD9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tsr1Q5SWD9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tsr1Q5SWD9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tsr1Q5SWD9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Tsr1Q5SWD9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tsr1Q5SWD9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tsr1Q5SWD9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tsr1Q5SWD9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tsr1Q5SWD9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tsr1Q5SWD9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Tsr1Q5SWD9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tsr1Q5SWD9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tsr1Q5SWD9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tsr1Q5SWD9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tsr1Q5SWD9 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tsr1Q5SWD9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Tsr1Q5SWD9 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tsr1Q5SWD9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tsr1Q5SWD9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tsr1Q5SWD9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tsr1Q5SWD9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tsr1Q5SWD9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tsr1Q5SWD9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tsr1Q5SWD9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tsr1Q5SWD9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tsr1Q5SWD9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tsr1Q5SWD9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tsr1Q5SWD9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tsr1Q5SWD9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.5 ms