Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD6

Vmn1r195, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r195Q5SVD6 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r195Q5SVD6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r195Q5SVD6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r195Q5SVD6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r195Q5SVD6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r195Q5SVD6 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vmn1r195Q5SVD6 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vmn1r195Q5SVD6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r195Q5SVD6 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r195Q5SVD6 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r195Q5SVD6 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r195Q5SVD6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r195Q5SVD6 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r195Q5SVD6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r195Q5SVD6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r195Q5SVD6 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r195Q5SVD6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r195Q5SVD6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r195Q5SVD6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r195Q5SVD6 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r195Q5SVD6 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r195Q5SVD6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r195Q5SVD6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r195Q5SVD6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r195Q5SVD6 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r195Q5SVD6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r195Q5SVD6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r195Q5SVD6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r195Q5SVD6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r195Q5SVD6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r195Q5SVD6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r195Q5SVD6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r195Q5SVD6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r195Q5SVD6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r195Q5SVD6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r195Q5SVD6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r195Q5SVD6 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r195Q5SVD6 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r195Q5SVD6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r195Q5SVD6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r195Q5SVD6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r195Q5SVD6 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r195Q5SVD6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r195Q5SVD6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r195Q5SVD6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r195Q5SVD6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r195Q5SVD6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r195Q5SVD6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r195Q5SVD6 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r195Q5SVD6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r195Q5SVD6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r195Q5SVD6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r195Q5SVD6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r195Q5SVD6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r195Q5SVD6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms