Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD5

Vmn1r196, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r196Q5SVD5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vmn1r196Q5SVD5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vmn1r196Q5SVD5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vmn1r196Q5SVD5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vmn1r196Q5SVD5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Vmn1r196Q5SVD5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vmn1r196Q5SVD5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vmn1r196Q5SVD5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vmn1r196Q5SVD5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vmn1r196Q5SVD5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vmn1r196Q5SVD5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vmn1r196Q5SVD5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vmn1r196Q5SVD5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vmn1r196Q5SVD5 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vmn1r196Q5SVD5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vmn1r196Q5SVD5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vmn1r196Q5SVD5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vmn1r196Q5SVD5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vmn1r196Q5SVD5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vmn1r196Q5SVD5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vmn1r196Q5SVD5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vmn1r196Q5SVD5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vmn1r196Q5SVD5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmn1r196Q5SVD5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmn1r196Q5SVD5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmn1r196Q5SVD5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmn1r196Q5SVD5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmn1r196Q5SVD5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmn1r196Q5SVD5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmn1r196Q5SVD5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmn1r196Q5SVD5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmn1r196Q5SVD5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vmn1r196Q5SVD5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Vmn1r196Q5SVD5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vmn1r196Q5SVD5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vmn1r196Q5SVD5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vmn1r196Q5SVD5 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vmn1r196Q5SVD5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vmn1r196Q5SVD5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vmn1r196Q5SVD5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vmn1r196Q5SVD5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vmn1r196Q5SVD5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vmn1r196Q5SVD5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vmn1r196Q5SVD5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vmn1r196Q5SVD5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vmn1r196Q5SVD5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vmn1r196Q5SVD5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Vmn1r196Q5SVD5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vmn1r196Q5SVD5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vmn1r196Q5SVD5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vmn1r196Q5SVD5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Vmn1r196Q5SVD5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vmn1r196Q5SVD5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vmn1r196Q5SVD5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vmn1r196Q5SVD5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vmn1r196Q5SVD5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vmn1r196Q5SVD5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vmn1r196Q5SVD5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vmn1r196Q5SVD5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vmn1r196Q5SVD5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vmn1r196Q5SVD5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Vmn1r196Q5SVD5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Vmn1r196Q5SVD5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Vmn1r196Q5SVD5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vmn1r196Q5SVD5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vmn1r196Q5SVD5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vmn1r196Q5SVD5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms